41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0059 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  188  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3387  hypothetical protein  36.49 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0467  hypothetical protein  34.57 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62565  normal  0.624691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00382  hypothetical protein  34.57 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00876967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0462  hypothetical protein  34.57 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0502  hypothetical protein  34.57 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.145396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00378  conserved hypothetical protein  34.57 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00680553  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  30.86 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  40.62 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  40.62 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  40.62 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  40.62 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  30.49 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  35.44 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  31.58 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  35.59 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  30 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  30 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  30.49 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  31.51 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  31.17 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  32.93 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  30.12 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  36.99 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  33.01 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  29.11 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  29.63 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  37.31 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  33.87 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1985  hypothetical protein  31.75 
 
 		 109 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  27.16 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  27.16 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  30 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  30.93 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  28.38 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  31.43 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  26.58 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  25.97 
 
 		 95 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  32.05 
 
 		 93 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  35.44 
 
 		 91 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>