27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3950 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  91.49 
 
 		 94 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  91.49 
 
 		 94 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  91.49 
 
 		 94 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  81.72 
 
 		 94 aa  150  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  73.4 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  73.4 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  73.4 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  73.4 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  56.7 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  53.12 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  56.25 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  47.37 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  49.48 
 
 		 97 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  38.36 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  35.29 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  34.52 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  34.52 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  34.52 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  36.71 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  35.56 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3646  putative anti-sigma B factor antagonist  33.71 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>