More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0483 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  100 
 
 		 107 aa  225  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  72.82 
 
 		 106 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  72.82 
 
 		 106 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  52.48 
 
 		 106 aa  127  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  51.49 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  51.49 
 
 		 104 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  50.5 
 
 		 104 aa  120  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  50.5 
 
 		 104 aa  120  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  50.5 
 
 		 104 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  50.5 
 
 		 104 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  50.5 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  50.5 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  49.5 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  49.5 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  48.51 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  48.51 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  36.63 
 
 		 104 aa  84.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  36.63 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  35.64 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  35.64 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  38.82 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  34.65 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  34.65 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  34.65 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  34.65 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  34.65 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  34.65 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  34.65 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  36.27 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  34.65 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  38.83 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  32.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  32.38 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  32.38 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  31.11 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  32.29 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.62 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  31.91 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1625  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000722607  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  29.52 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  32.26 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  30.99 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  26.04 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.47 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  27.45 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  33.73 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  27.45 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0425  thioredoxin domain-containing protein  28.75 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  30.19 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  30.19 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  30.19 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  30.19 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  30.19 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  31.71 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  30.23 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  30.19 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  30.19 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  31.91 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  31.91 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  23.3 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  31.87 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  29.25 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  31.91 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  26.21 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  30.85 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  28.3 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  30.21 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  29.41 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  29.81 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  33.77 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  33 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  34.21 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  31.87 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  30.68 
 
 		 406 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  33 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  27.36 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  29.67 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  29.36 
 
 		 272 aa  50.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  30.53 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  27.72 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  26.44 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  25.47 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2606  putative thioredoxin-like protein  26.37 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.888104  normal  0.656305 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  29.76 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  30.77 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  29.67 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  29 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  25.81 
 
 		 287 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>