228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2712 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2712  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
206 aa  401  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2958  Rieske (2Fe-2S) region  46.19 
 
 
223 aa  171  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.29 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.29 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.55 
 
 
139 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  41.94 
 
 
139 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.11 
 
 
435 aa  61.2  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.64 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.86 
 
 
139 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  48.28 
 
 
131 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  40.62 
 
 
139 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.84 
 
 
148 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.98 
 
 
166 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  42.37 
 
 
181 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.64 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0488  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.67 
 
 
169 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.64 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.64 
 
 
178 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1432  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.8 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.8 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.8 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000922342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  42.47 
 
 
172 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1649  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.8 
 
 
170 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.670626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.83 
 
 
227 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.45 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2131  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.64 
 
 
168 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000114476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1447  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.32 
 
 
170 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267387  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  39.44 
 
 
178 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 
508 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.14 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.77 
 
 
525 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
642 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  35.82 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  30.77 
 
 
525 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  38.81 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.03 
 
 
178 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1686  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.31 
 
 
124 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
508 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  51.06 
 
 
63 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.03 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1799  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.26 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.183814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.3 
 
 
146 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05261  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.100981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  46.43 
 
 
131 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  36.51 
 
 
508 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.51 
 
 
508 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  36.51 
 
 
508 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  36.51 
 
 
508 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.51 
 
 
508 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.51 
 
 
508 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.51 
 
 
508 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  34.72 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 
508 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.35 
 
 
640 aa  52.4  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.18 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.02 
 
 
130 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1794  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  37.8 
 
 
178 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  44.44 
 
 
181 aa  52  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  41.1 
 
 
269 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05171  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  37.8 
 
 
178 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.900646  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0781  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  29.19 
 
 
180 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  36.51 
 
 
508 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0755  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  29.19 
 
 
180 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06651  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  30.34 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  36.51 
 
 
508 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.62 
 
 
381 aa  51.6  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.33 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  30.71 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 
504 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.89 
 
 
269 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.89 
 
 
269 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  37.88 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1246  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.8 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
507 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  33.72 
 
 
440 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3950  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  27.22 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  23.59 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.84 
 
 
644 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.94 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.76 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 
513 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1958  cytochrome b6/f complex Fe-S subunit  34.33 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.88 
 
 
359 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1921  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  42.86 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000679978  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  41.67 
 
 
645 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  37.93 
 
 
512 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  40.32 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.7 
 
 
639 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13358  predicted protein  34.72 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2527  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.513759  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  37.93 
 
 
648 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1419  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  35.21 
 
 
179 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000338056  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3767  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  35 
 
 
146 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.21 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000461965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1544  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  35 
 
 
146 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  41.18 
 
 
179 aa  49.3  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2851  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.11 
 
 
167 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  39.44 
 
 
149 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1616  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  35 
 
 
146 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0880951 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.11 
 
 
166 aa  48.9  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>