More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1432 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
185 aa  371  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  59.65 
 
 
180 aa  191  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  56.97 
 
 
170 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
173 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
178 aa  185  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
170 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
170 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
170 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
170 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
170 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
170 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
170 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
170 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
170 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
171 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
172 aa  179  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
170 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
172 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
172 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
170 aa  177  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
171 aa  177  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
170 aa  177  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
172 aa  177  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
170 aa  176  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
171 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 
176 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
214 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
170 aa  175  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
172 aa  174  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
171 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  174  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  46.93 
 
 
181 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
170 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
174 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
182 aa  171  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
172 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
172 aa  169  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
172 aa  169  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
172 aa  169  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
177 aa  170  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
172 aa  170  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  46.93 
 
 
181 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
172 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  168  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  168  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
172 aa  168  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  168  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  168  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  49.1 
 
 
183 aa  168  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
173 aa  168  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  168  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  168  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
183 aa  168  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
184 aa  167  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
171 aa  168  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
173 aa  167  6e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
174 aa  167  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
170 aa  167  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
173 aa  167  7e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
198 aa  167  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  46.93 
 
 
181 aa  167  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  44.75 
 
 
185 aa  167  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 
177 aa  167  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
184 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
184 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
184 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
177 aa  167  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
184 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
177 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
193 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 
185 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
184 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
168 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
184 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
197 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
171 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
172 aa  165  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
171 aa  165  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  47.73 
 
 
185 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 
176 aa  164  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
181 aa  164  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
183 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>