More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2516 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  100 
 
 
210 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  99.05 
 
 
210 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  74.76 
 
 
216 aa  296  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  52.86 
 
 
224 aa  207  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  50.25 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  53.08 
 
 
226 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  49.25 
 
 
224 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  49.3 
 
 
234 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  51.22 
 
 
220 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  50.97 
 
 
246 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  56.11 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  50.49 
 
 
235 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  49.24 
 
 
206 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  49.03 
 
 
245 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  47.12 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.75 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
271 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  41.23 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
273 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
200 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
200 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  35.95 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.23 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.54 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1338  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.54 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.87 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0007  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.54 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.58 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.75 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.97 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.71 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
327 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
278 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
199 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.06 
 
 
252 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10568  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.77 
 
 
234 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0587656  normal  0.225311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
252 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.2 
 
 
213 aa  58.2  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.3 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.65 
 
 
299 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.09 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  28.57 
 
 
907 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3054  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  39.82 
 
 
328 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.05 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
250 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
281 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.41 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.3 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0374  demethylmenaquinone methyltransferase  36.3 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.4 
 
 
258 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  35.21 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.79 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.35 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0403  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.3 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 
354 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
365 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
349 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.83 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 
342 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.04 
 
 
235 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  33.05 
 
 
268 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.97 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.82 
 
 
260 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.9 
 
 
221 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  37.24 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
339 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.93 
 
 
248 aa  55.1  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.6 
 
 
241 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.6 
 
 
241 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.89 
 
 
237 aa  54.7  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.03 
 
 
257 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.99 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.33 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
335 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
624 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  43.81 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.7 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  28.92 
 
 
771 aa  54.3  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>