45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1722 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  352  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  98.29 
 
 		 175 aa  346  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  76.03 
 
 		 176 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.66 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  41.79 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  38.79 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  37.93 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  34.73 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  40.88 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  36.91 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  36.55 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  35.1 
 
 		 169 aa  98.2  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  36.04 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  33.55 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  34.21 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  30.99 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  34.72 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  35.09 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  29.68 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  37.17 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  33.04 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  34.38 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  36.73 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  27.21 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  31.16 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  31.88 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  31.88 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  31.88 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  30.94 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  30.22 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  35.54 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  28.06 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.06 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  29.66 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  28.06 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.06 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  26.81 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  28.26 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.06 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  34.43 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  31.31 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  27.11 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  27.11 
 
 		 196 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  26.95 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>