37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0031 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1033    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  46.23 
 
 
511 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  41.86 
 
 
514 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  41.76 
 
 
511 aa  365  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  43.07 
 
 
499 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  36.82 
 
 
518 aa  299  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  34.7 
 
 
590 aa  200  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  36.89 
 
 
499 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  36.89 
 
 
499 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  36.89 
 
 
499 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  36.89 
 
 
499 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  36.89 
 
 
499 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  36.89 
 
 
499 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  36.89 
 
 
499 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  32.14 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  31.71 
 
 
512 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  30.66 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
535 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  26.73 
 
 
514 aa  95.1  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  25.91 
 
 
523 aa  93.6  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 
542 aa  90.1  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  23.99 
 
 
494 aa  89.7  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  26.28 
 
 
564 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  25.71 
 
 
535 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  24.62 
 
 
482 aa  84.7  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  23.66 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  32.29 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  25.25 
 
 
518 aa  80.1  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  25.65 
 
 
521 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  23.36 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  28.16 
 
 
503 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  32.03 
 
 
252 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  26.1 
 
 
1144 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  23.55 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  22.86 
 
 
509 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  26.82 
 
 
1143 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  27.83 
 
 
1116 aa  53.9  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>