45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3141 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 		 455 aa  923    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  53.2 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  43.27 
 
 		 467 aa  336  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  42.83 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  32.27 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  33.1 
 
 		 445 aa  177  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  32.87 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  32.17 
 
 		 454 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  30.3 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  31.67 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  32.01 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  31.54 
 
 		 452 aa  166  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  32.04 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  31.66 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  31.58 
 
 		 447 aa  156  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 453 aa  150  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  30.48 
 
 		 451 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  32.37 
 
 		 455 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  29.57 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  29.75 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  30.63 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  29.98 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  28.12 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  28.12 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  26.62 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  28.51 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  26.88 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  29.03 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  26.63 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  26.12 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  28.61 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  25.56 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  25.84 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  25.82 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  24.29 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  25.09 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  25.09 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  22.27 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  23.3 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  24.79 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  22.91 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  25.47 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>