41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2861 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  391  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  45.7 
 
 
197 aa  177  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  42.47 
 
 
196 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  47.59 
 
 
712 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  40 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  30.3 
 
 
678 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  39.36 
 
 
309 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  38.3 
 
 
403 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  42.17 
 
 
643 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  36.9 
 
 
596 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2663  hypothetical protein  32.61 
 
 
413 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.236265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
241 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1495  hypothetical protein  36.47 
 
 
220 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294905  normal  0.282523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  35.96 
 
 
535 aa  51.2  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
281 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
243 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  28.69 
 
 
500 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  33.67 
 
 
209 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
278 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  38.57 
 
 
233 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0297  hypothetical protein  29.03 
 
 
299 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.541993  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0297  hypothetical protein  29.03 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
284 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.5 
 
 
345 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  35.44 
 
 
272 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.46 
 
 
764 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
442 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
222 aa  42  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  30.49 
 
 
240 aa  41.6  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
262 aa  41.6  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
196 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
242 aa  41.6  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
260 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  30.82 
 
 
172 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2992  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
229 aa  41.2  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.547914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
711 aa  41.2  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  31.71 
 
 
294 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
222 aa  41.2  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>