More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2626 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  100 
 
 
326 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  50.32 
 
 
336 aa  262  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  46.83 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.94 
 
 
392 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  43.79 
 
 
301 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  43.95 
 
 
303 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  47.15 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47 
 
 
297 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  45.85 
 
 
307 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.47 
 
 
323 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.11 
 
 
306 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  43.6 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.54 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  42.38 
 
 
304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  43.71 
 
 
324 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.84 
 
 
317 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.51 
 
 
320 aa  218  8.999999999999998e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4767  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.48 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272795  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  41.39 
 
 
310 aa  209  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  38.99 
 
 
299 aa  206  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.84 
 
 
313 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  41.07 
 
 
323 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.19 
 
 
304 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  37.85 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.55 
 
 
308 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  42.14 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.06 
 
 
318 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.51 
 
 
319 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  38.6 
 
 
319 aa  192  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1391  heat shock protein DnaJ domain protein  39.7 
 
 
322 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.42 
 
 
283 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.23 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  38.61 
 
 
302 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.75 
 
 
324 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  38.15 
 
 
310 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  36.05 
 
 
287 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  36.47 
 
 
309 aa  186  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  36.96 
 
 
294 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  38.18 
 
 
313 aa  185  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  36.76 
 
 
333 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  35.91 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  36.15 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  36.96 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  35.29 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  38.01 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  41.23 
 
 
325 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  36.01 
 
 
341 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  36.62 
 
 
311 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  35.44 
 
 
333 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  38.22 
 
 
301 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.74 
 
 
324 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  39.81 
 
 
320 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.69 
 
 
317 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  33.24 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.13 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.76 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.93 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  36.39 
 
 
339 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  37.46 
 
 
335 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.5 
 
 
325 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  37.73 
 
 
326 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  37.35 
 
 
324 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  37.81 
 
 
315 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  34.87 
 
 
335 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  34.87 
 
 
335 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  38.87 
 
 
313 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  34.86 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  34.58 
 
 
378 aa  172  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  33.24 
 
 
374 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  38.56 
 
 
295 aa  172  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  37.08 
 
 
318 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  37.08 
 
 
318 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.96 
 
 
315 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  37.34 
 
 
297 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  37.34 
 
 
297 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.01 
 
 
315 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.01 
 
 
312 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  35.77 
 
 
335 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.28 
 
 
324 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  33.75 
 
 
299 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  33.62 
 
 
382 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  35.93 
 
 
376 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.3 
 
 
319 aa  169  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  36.47 
 
 
318 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  40 
 
 
302 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  35.12 
 
 
313 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  37.35 
 
 
327 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.8 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  32.4 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  35 
 
 
297 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  31.83 
 
 
337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.19 
 
 
306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  37.95 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.19 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  33.15 
 
 
378 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  34.45 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.19 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.19 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.19 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  31.79 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>