58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1280 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 
323 aa  630  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.22 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  29.39 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.28 
 
 
300 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.12 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  33.62 
 
 
296 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  32.45 
 
 
317 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  28.33 
 
 
316 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.9 
 
 
301 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  30.63 
 
 
301 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  29.19 
 
 
325 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  31.84 
 
 
268 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  29.28 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  30.18 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.43 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  37.18 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.18 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  36.36 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  32.53 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  26.51 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  32.03 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  32 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  38.89 
 
 
286 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  35.56 
 
 
329 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  30.61 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  56.36 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  30.33 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  51.02 
 
 
288 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  54.9 
 
 
142 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  36.96 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1918  hypothetical protein  34.78 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  61.36 
 
 
162 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00190  hypothetical protein  31.75 
 
 
314 aa  49.7  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  54.9 
 
 
142 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  47.54 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  43.28 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  48.94 
 
 
149 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  29.22 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4502  HPr kinase  32.35 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1592  HPr kinase  45.65 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  50.98 
 
 
142 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  36.49 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  34.38 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  52.17 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.82 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  39.29 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  40.35 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  39.29 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3381  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.71 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0856  hypothetical protein  32.28 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  40.3 
 
 
285 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  42.55 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  41.82 
 
 
307 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  40.74 
 
 
305 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  41.82 
 
 
307 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  47.83 
 
 
154 aa  43.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  55 
 
 
141 aa  42.7  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>