More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1253 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 454 aa  915    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  57.24 
 
 		 448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  57.4 
 
 		 451 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  57.81 
 
 		 448 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  57.92 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  57.92 
 
 		 448 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  57.37 
 
 		 448 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  55.81 
 
 		 448 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  55.81 
 
 		 448 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  55.81 
 
 		 448 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  57.24 
 
 		 448 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  57.24 
 
 		 448 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  57.24 
 
 		 448 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  38.62 
 
 		 460 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  38.62 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  38.62 
 
 		 460 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  37.56 
 
 		 458 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  37.22 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  38.17 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  37.56 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  37.22 
 
 		 458 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  35.7 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  35.92 
 
 		 458 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  36.14 
 
 		 458 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  36.14 
 
 		 458 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  36.5 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  35.62 
 
 		 458 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  36.5 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  36.42 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  34.37 
 
 		 458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  37.78 
 
 		 472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  34.37 
 
 		 458 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  37.75 
 
 		 472 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  40.09 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  37.28 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  37.28 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  37.06 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  37.06 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  37.06 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  37.06 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  37.06 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  36.47 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  36.88 
 
 		 472 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  36.69 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  37.06 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  37.53 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  37.75 
 
 		 465 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  38.07 
 
 		 466 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  35.25 
 
 		 459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  39.69 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  33.41 
 
 		 463 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  36.84 
 
 		 453 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  37.53 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  35.75 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  35.33 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  35.67 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  34.32 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  34.47 
 
 		 455 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  33.71 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  35.73 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0302  glutamate--putrescine ligase  34.47 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  37.47 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  34.83 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  36.93 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  37.69 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  33.71 
 
 		 476 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  35.24 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  35.92 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  35.71 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  33.48 
 
 		 476 aa  216  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  35.09 
 
 		 455 aa  216  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  35.02 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  37.61 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  35.02 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 		 445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  35.24 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  36.08 
 
 		 456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  33.41 
 
 		 445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  33.33 
 
 		 475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  35.89 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35.48 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35.48 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.48 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  37.03 
 
 		 459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  35.83 
 
 		 456 aa  213  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  35.62 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  35.63 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  35.48 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  36.67 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  35.4 
 
 		 490 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  35.03 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  35.25 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  36.12 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  35.41 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  35.41 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  35.41 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  35.41 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  35.4 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  35.19 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  36.28 
 
 		 454 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>