More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0802 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  100 
 
 		 276 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  56.23 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  54.68 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  52.67 
 
 		 276 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  51.53 
 
 		 279 aa  271  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  51.15 
 
 		 276 aa  271  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  50.94 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  51.15 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  52.47 
 
 		 277 aa  268  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  53.28 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  55.64 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  55.64 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  55.47 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  50.57 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  54.92 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  50 
 
 		 295 aa  261  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  50.58 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  49.64 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  50.19 
 
 		 277 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  51.7 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  53.64 
 
 		 276 aa  254  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  49.24 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  50.57 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  49.62 
 
 		 285 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  52.33 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  49.43 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  49.26 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  48.89 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  49.81 
 
 		 276 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  48.48 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  48.7 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  48.5 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  48.69 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  48.13 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  47.69 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  47.94 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  50.57 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  47.74 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  47.74 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  47.74 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  50.97 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 		 608 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  46.24 
 
 		 613 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 		 293 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4052  ABC transporter related  44.7 
 
 		 612 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0831351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4369  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 		 336 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.21 
 
 		 357 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  46.15 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3308  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  45.83 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  46.33 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3235  ABC peptide transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3972  ABC transporter related  45.74 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.3 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2923  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 328 aa  208  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.37 
 
 		 555 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  44.92 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.56 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.58 
 
 		 334 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0195088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.58 
 
 		 334 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.542128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0907  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  44.06 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000823752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4657  ABC transporter related  43.02 
 
 		 605 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168066  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3825  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.74 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3947  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.74 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3839  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.74 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8931  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.74 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4007  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.74 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.81 
 
 		 371 aa  204  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0141  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 		 326 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  44.7 
 
 		 557 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0983  ABC transporter related  39.61 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0278331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0193  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.79 
 
 		 343 aa  203  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4246  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.24 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2814  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.58 
 
 		 340 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.241348  normal  0.0563642 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5352  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.4 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1733  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.04 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.13 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 		 338 aa  202  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.88 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4234  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.88 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.38 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3904  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.32 
 
 		 326 aa  201  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.463258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4393  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  40.51 
 
 		 338 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4733  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  40.51 
 
 		 338 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3924  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.00444636 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.45 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000196447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4095  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.32 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  43.56 
 
 		 557 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 359 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.218091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>