More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0528 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0528  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
418 aa  823    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  40.23 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  39.08 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  56.67 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1980  chaperone protein DnaJ  51.67 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0707  chaperone protein DnaJ  55 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000115136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  54.1 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  54.55 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00490  chaperone regulator, putative  54.1 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2074  chaperone protein DnaJ  53.33 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  45.59 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  47.06 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  51.67 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7924  chaperone, dnaj-like protein  50.82 
 
 
66 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1647  chaperone protein DnaJ  44.12 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51193  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  42.68 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  36.89 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  50.72 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0839  heat shock protein DnaJ  48.39 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0215483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  45.83 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  47.89 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  45 
 
 
396 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  54.24 
 
 
391 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 
377 aa  67  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13550  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  49.18 
 
 
385 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.685498 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00580  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  37.23 
 
 
297 aa  67  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0451  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.240923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
377 aa  67  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.59 
 
 
291 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3636  heat shock protein DnaJ, N-terminal  48.39 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00302094  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  39.53 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  46.38 
 
 
375 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  39.53 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  51.67 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1286  chaperone DnaJ  47.54 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  44.62 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10330  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0686048  unclonable  0.00000000184085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1644  chaperone protein DnaJ  50.85 
 
 
374 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2765  chaperone protein DnaJ  50.85 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
375 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2553  chaperone DnaJ domain protein  48.39 
 
 
309 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.0279276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1151  chaperone protein DnaJ  51.67 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0087  chaperone protein DnaJ  41.03 
 
 
373 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.60044  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  46.03 
 
 
361 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  47.62 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0830  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57157  predicted protein  42.47 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.293411  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1060  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00149105  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  37.36 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1483  chaperone protein DnaJ  45.9 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.387506  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  43.28 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0511  chaperone protein DnaJ  47.62 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.100964  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  51.67 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  49.18 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  50.79 
 
 
634 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4231  chaperone DnaJ domain protein  48.61 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2086  DnaJ domain-containing protein  50.79 
 
 
172 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000110327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  42.65 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2702  chaperone protein DnaJ  49.18 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  42.65 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2850  chaperone protein DnaJ  41.79 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  46.38 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  46.27 
 
 
298 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  33.6 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  40.28 
 
 
368 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  45.71 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  49.18 
 
 
383 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  47.54 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85654  yeast dnaJ homolog (nuclear envelope protein) heat shock protein  41.94 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351399  normal  0.0803186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  49.18 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  47.76 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0796  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.751342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  43.48 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3476  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.28 
 
 
291 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00429307  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03090  conserved hypothetical protein  47.46 
 
 
490 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  43.66 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  41.43 
 
 
309 aa  64.7  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  45.31 
 
 
386 aa  65.1  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1403  chaperone protein DnaJ  38.03 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00904898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>