More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13550  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  100 
 
 
385 aa  770    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.685498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1242  chaperone DnaJ domain protein  74.16 
 
 
384 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0347494  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12398  chaperone protein DnaJ  63.19 
 
 
382 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000162557  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3836  chaperone protein DnaJ  61.92 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.575279  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2702  chaperone protein DnaJ  64.33 
 
 
381 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3470  chaperone protein DnaJ  60.1 
 
 
384 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3459  chaperone protein DnaJ  60.1 
 
 
384 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3522  chaperone protein DnaJ  60.1 
 
 
384 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3835  chaperone protein DnaJ  60.16 
 
 
382 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.504584  hitchhiker  0.000855612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2110  chaperone protein DnaJ  63.16 
 
 
380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1265  chaperone DnaJ  63.56 
 
 
379 aa  401  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0905779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1644  chaperone protein DnaJ  63.25 
 
 
374 aa  401  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3455  chaperone protein DnaJ  58.85 
 
 
381 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1572  chaperone DnaJ domain protein  62.76 
 
 
386 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.0160005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2765  chaperone protein DnaJ  58.76 
 
 
389 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137899  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  57.33 
 
 
377 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0590762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0839  heat shock protein DnaJ  51.57 
 
 
379 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0215483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5455  chaperone protein DnaJ  57.81 
 
 
389 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7057  chaperone protein DnaJ  56.4 
 
 
378 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  53.4 
 
 
374 aa  365  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3162  chaperone DnaJ domain protein  56.15 
 
 
387 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.354519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3252  chaperone protein DnaJ  55.87 
 
 
376 aa  364  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  52.48 
 
 
375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  51.7 
 
 
375 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2191  chaperone DnaJ domain protein  51.97 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13440  chaperone protein DnaJ  51.57 
 
 
372 aa  355  6.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1151  chaperone protein DnaJ  53.4 
 
 
376 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0702  chaperone protein DnaJ  51.44 
 
 
379 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3405  chaperone protein DnaJ  53 
 
 
375 aa  332  6e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1549  chaperone DnaJ domain protein  51.3 
 
 
372 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1749  chaperone DnaJ domain protein  51.7 
 
 
375 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.378559  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11700  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  52.49 
 
 
376 aa  323  4e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482497  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2290  chaperone DnaJ  51.03 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1904  chaperone protein DnaJ  53.3 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  44.1 
 
 
386 aa  293  5e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0900  putative chaperone protein DnaJ  40.89 
 
 
383 aa  292  6e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17290  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  46.35 
 
 
375 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  43.31 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  44.95 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  42.56 
 
 
370 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  45.03 
 
 
384 aa  280  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  43.98 
 
 
373 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  43.21 
 
 
356 aa  279  6e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
380 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  46.72 
 
 
377 aa  275  7e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  42.11 
 
 
356 aa  275  8e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  41.9 
 
 
379 aa  275  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  41.71 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  42.98 
 
 
375 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  44.81 
 
 
373 aa  273  5.000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  45.14 
 
 
382 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  40.97 
 
 
385 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  42.54 
 
 
359 aa  270  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  43.2 
 
 
381 aa  269  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  42.71 
 
 
377 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 
370 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0444  DnaJ-class molecular chaperone  43.34 
 
 
381 aa  267  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.771058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  42.74 
 
 
377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  42.67 
 
 
375 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  41.51 
 
 
375 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  44.2 
 
 
379 aa  265  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  42.93 
 
 
373 aa  265  8e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  42.93 
 
 
382 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 
372 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  41.45 
 
 
374 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 
372 aa  263  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2042  chaperone protein DnaJ  42.71 
 
 
377 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  43.33 
 
 
378 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  40.05 
 
 
380 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  44.54 
 
 
376 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2126  chaperone protein DnaJ  42.45 
 
 
377 aa  262  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.549127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  41.3 
 
 
384 aa  263  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  44.26 
 
 
378 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  44.26 
 
 
378 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  44.26 
 
 
378 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  44.72 
 
 
376 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  43.99 
 
 
378 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  44.72 
 
 
376 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  43.99 
 
 
378 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  44.72 
 
 
376 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  43.56 
 
 
380 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  44.72 
 
 
376 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  41.49 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  39.69 
 
 
379 aa  259  6e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  44.26 
 
 
378 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
376 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
374 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  41.07 
 
 
382 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1577  chaperone DnaJ  41.45 
 
 
377 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.277961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  39.69 
 
 
375 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  44.23 
 
 
380 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  43.04 
 
 
380 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  42.74 
 
 
380 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  40.8 
 
 
382 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  45.98 
 
 
375 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  42.27 
 
 
381 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  44.35 
 
 
379 aa  255  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>