More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0294 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  56.8 
 
 		 212 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  55.83 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  56.54 
 
 		 216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  55.83 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  57.28 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  54.37 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  60 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  56.31 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  52.91 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  53.88 
 
 		 212 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  60.73 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  55.19 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  53.33 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  55.22 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  57.64 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  53.88 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  55.15 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  51.49 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  48.56 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  48.56 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  49.04 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  49.03 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  46.95 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  59.41 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  45.15 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  52.43 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  54.92 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  54.37 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  54.92 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  59.16 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  48.06 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  54.37 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  47.09 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  53.06 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  53.88 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  50 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  54.85 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  35.87 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  41.04 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  49.75 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  41.48 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  41.48 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  41.48 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  41.48 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  41.48 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.37 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  41.52 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  42.59 
 
 		 221 aa  147  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  41.85 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  37.22 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  55.1 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.6 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3036  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.15 
 
 		 653 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2070  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  41.48 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  43.19 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  39.11 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.55 
 
 		 670 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  39.04 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.4 
 
 		 667 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  42.13 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  42.13 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>