37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4399 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  100 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  100 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  81.41 
 
 		 162 aa  228  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  47.89 
 
 		 160 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  45.33 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  45.27 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  43.36 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  50.85 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  40.77 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  38.46 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  42.75 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  42.75 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  37.88 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  35.86 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  35.82 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  35.97 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  33.93 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  35.16 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  33.78 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  28.17 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  36.19 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  29.61 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  31.25 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  29.68 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  32.52 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  34.23 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  32.09 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  32.67 
 
 		 738 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  33.33 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  32.67 
 
 		 738 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  31.52 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  27.2 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  34.09 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  35.26 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  32.48 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  34.94 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  35.14 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>