More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1843 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  93.55 
 
 		 217 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  81.11 
 
 		 218 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  66.04 
 
 		 213 aa  279  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  64.15 
 
 		 213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.17 
 
 		 220 aa  260  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.43 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.57 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.52 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3183  putative glutathione S-transferase  46.67 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0938037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  48.15 
 
 		 218 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  47.64 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  47.03 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.57 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.57 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.57 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  48.57 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.57 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1982  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.92 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  48.57 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  47.17 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  47.17 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  47.17 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  47.22 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1372  Glutathione S-transferase domain  45.71 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00129076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.26 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  44.88 
 
 		 224 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  42.47 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.79 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.35 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  41.35 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1613  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.26 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1807  hypothetical protein  35.58 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  31.98 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.51 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  35 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  27.78 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  27.88 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  29.41 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.97 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0706663  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  30.38 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  30.38 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  30.63 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  34.29 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2216  Glutathione S-transferase domain protein  30.38 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.13 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2467  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.3 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  33.71 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13090  Stringent starvation protein A  29.94 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  28.57 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  30.15 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.11 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  32.77 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.12 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  27.62 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.1 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.76 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  26.22 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  29.78 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  28.57 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  27.5 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  32.56 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  29.45 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  28.74 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  28.83 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  28.44 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4163  stringent starvation protein A  29.3 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0804  stringent starvation protein A  29.11 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000607549  hitchhiker  0.0080229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.12 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  28.03 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2871  stringent starvation protein A  27.14 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  26.88 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.53 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.41 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.19 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  28.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>