46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4587 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4587  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 429 aa  873    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4315  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3710  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 399 aa  100  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4346  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.795348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0312  glycosyl transferase, group 1  23 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.018829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3507  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89342e-22 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2155  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.824181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4582  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  36 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 		 358 aa  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 389 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 		 368 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  30.77 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 768 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 346 aa  47.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  43.14 
 
 		 368 aa  46.6  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  21.96 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3640  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 698 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0320  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  22.34 
 
 		 424 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  27 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1433  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 375 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04491  putative glycosyl transferase, group 1  22.34 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 744 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0522  hypothetical protein  21.87 
 
 		 341 aa  43.1  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>