More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2143 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  79.32 
 
 		 486 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  76.57 
 
 		 486 aa  697    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  84.25 
 
 		 489 aa  804    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  81.38 
 
 		 486 aa  771    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 482 aa  953    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  84.08 
 
 		 490 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  77.41 
 
 		 486 aa  736    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.56 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  55.48 
 
 		 481 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.43 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.08 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  54.64 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 		 502 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  54.98 
 
 		 476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.1 
 
 		 477 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.17 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.97 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  49.89 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.96 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  49.89 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 		 469 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  44.79 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  44.92 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  44.91 
 
 		 468 aa  349  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 492 aa  296  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 488 aa  276  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 468 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 480 aa  240  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 481 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 533 aa  226  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.110579  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  30.95 
 
 		 457 aa  203  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  32.02 
 
 		 476 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 461 aa  197  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 456 aa  196  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4799  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 449 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 463 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2785  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 499 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 469 aa  186  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6012  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 463 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 463 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2084  histidine kinase  32.26 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  39.13 
 
 		 483 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2101  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 463 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3520  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4109  histidine kinase  34.87 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0849  Two-component sensor histidine kinase protein  31 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0015  histidine kinase  31.51 
 
 		 468 aa  171  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3298  sensor histidine kinase  35.17 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251019  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 419 aa  169  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3128  sensor histidine kinase  30.31 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.850731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2953  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.131709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0663  histidine kinase  28.66 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00720978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03340  Signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 468 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 418 aa  166  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  33.44 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  34.11 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 461 aa  163  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2038  histidine kinase  29.12 
 
 		 481 aa  163  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132314  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0891  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 499 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00459895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  35.39 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0110  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.3 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0050254  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  30.35 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.09 
 
 		 466 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 386 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 455 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 487 aa  143  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1600  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.298704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>