More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4397 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  40.15 
 
 		 842 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  40.6 
 
 		 832 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  69.95 
 
 		 830 aa  1221    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  41.18 
 
 		 827 aa  687    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.13 
 
 		 842 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  96.51 
 
 		 832 aa  1624    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  40.84 
 
 		 834 aa  641    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  40.36 
 
 		 827 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  42.87 
 
 		 842 aa  683    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  40.98 
 
 		 843 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 832 aa  1684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  40.24 
 
 		 833 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  67.9 
 
 		 835 aa  1181    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  41.26 
 
 		 840 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  40.46 
 
 		 841 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  39.62 
 
 		 830 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  39.52 
 
 		 816 aa  634  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.95 
 
 		 828 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  39.33 
 
 		 841 aa  619  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  39.73 
 
 		 835 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  41.65 
 
 		 818 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  39.64 
 
 		 828 aa  616  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  39.4 
 
 		 835 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.5 
 
 		 836 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  39.13 
 
 		 836 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  38.96 
 
 		 828 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  38.84 
 
 		 836 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  38.69 
 
 		 835 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  39.14 
 
 		 843 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.75 
 
 		 836 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.38 
 
 		 842 aa  601  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  36.96 
 
 		 820 aa  595  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  36.68 
 
 		 810 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  37.53 
 
 		 820 aa  571  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.16 
 
 		 837 aa  560  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  36.19 
 
 		 818 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  38.12 
 
 		 833 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  36.23 
 
 		 828 aa  529  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  37.92 
 
 		 821 aa  525  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  33.66 
 
 		 854 aa  443  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  32.41 
 
 		 776 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  30.45 
 
 		 785 aa  399  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  35.59 
 
 		 784 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  35.59 
 
 		 784 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.59 
 
 		 784 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  35.59 
 
 		 784 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  34.1 
 
 		 784 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.59 
 
 		 784 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  34.1 
 
 		 784 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  35.07 
 
 		 784 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  37.86 
 
 		 712 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  35.07 
 
 		 784 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  34.9 
 
 		 784 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  41.37 
 
 		 370 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  41.1 
 
 		 370 aa  298  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  36.75 
 
 		 392 aa  270  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  36.77 
 
 		 370 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  37.01 
 
 		 399 aa  266  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  35.93 
 
 		 361 aa  261  4e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  36.21 
 
 		 361 aa  259  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  35.93 
 
 		 361 aa  258  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  36.17 
 
 		 392 aa  253  7e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  38.55 
 
 		 343 aa  253  8.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 		 392 aa  242  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  34.87 
 
 		 387 aa  241  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  33.78 
 
 		 387 aa  240  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  38.53 
 
 		 346 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  38.08 
 
 		 366 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  36.73 
 
 		 349 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  39.06 
 
 		 347 aa  234  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 		 387 aa  233  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  37.94 
 
 		 347 aa  229  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  37.87 
 
 		 367 aa  227  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  35.16 
 
 		 381 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  39.44 
 
 		 329 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  35.08 
 
 		 348 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.43 
 
 		 392 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.43 
 
 		 392 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.13 
 
 		 389 aa  217  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 392 aa  216  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.21 
 
 		 392 aa  216  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.92 
 
 		 392 aa  215  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.32 
 
 		 392 aa  215  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.21 
 
 		 392 aa  213  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  35.33 
 
 		 389 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.32 
 
 		 392 aa  211  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  32.98 
 
 		 357 aa  210  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  33.7 
 
 		 359 aa  209  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.86 
 
 		 392 aa  208  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  34.68 
 
 		 388 aa  207  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  36.55 
 
 		 359 aa  207  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 		 359 aa  207  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  34.41 
 
 		 370 aa  207  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.57 
 
 		 392 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 363 aa  204  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  34.66 
 
 		 389 aa  204  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 		 359 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 		 359 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 		 359 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  29.52 
 
 		 450 aa  198  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>