70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1024 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  100 
 
 		 668 aa  1328    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  49.78 
 
 		 938 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  26.21 
 
 		 803 aa  91.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.2 
 
 		 748 aa  91.7  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.26 
 
 		 530 aa  88.2  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.7 
 
 		 651 aa  82.4  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.27 
 
 		 410 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  29.46 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.1 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.09 
 
 		 683 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  33.96 
 
 		 700 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.64 
 
 		 606 aa  54.7  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  25.51 
 
 		 589 aa  54.7  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  29.25 
 
 		 587 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.8 
 
 		 530 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  26.67 
 
 		 662 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  25.71 
 
 		 603 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  21.76 
 
 		 465 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.36 
 
 		 743 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  21.76 
 
 		 459 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  27.71 
 
 		 403 aa  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  26.67 
 
 		 598 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  21.76 
 
 		 459 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.97 
 
 		 819 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  26.48 
 
 		 362 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  26.48 
 
 		 362 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  26.48 
 
 		 362 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  26.48 
 
 		 362 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  26.48 
 
 		 362 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  26.48 
 
 		 362 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  26.47 
 
 		 743 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.56 
 
 		 722 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  25.91 
 
 		 599 aa  50.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  33.65 
 
 		 524 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  32.38 
 
 		 539 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  28.19 
 
 		 629 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  21.97 
 
 		 705 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  26.46 
 
 		 303 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  26.09 
 
 		 362 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.09 
 
 		 362 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  26.72 
 
 		 734 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  31.25 
 
 		 687 aa  48.5  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.12 
 
 		 605 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.14 
 
 		 421 aa  48.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.37 
 
 		 795 aa  48.1  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.11 
 
 		 568 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  23.98 
 
 		 851 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.58 
 
 		 723 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  34.95 
 
 		 899 aa  47.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  35 
 
 		 365 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  35.11 
 
 		 363 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  30.39 
 
 		 517 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  32 
 
 		 666 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  25.34 
 
 		 741 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  32.53 
 
 		 862 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  26.38 
 
 		 481 aa  46.2  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  25.75 
 
 		 678 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.47 
 
 		 398 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.04 
 
 		 325 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  40.35 
 
 		 318 aa  45.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.77 
 
 		 822 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.56 
 
 		 626 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  25.61 
 
 		 475 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  28.38 
 
 		 498 aa  44.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  33.08 
 
 		 369 aa  44.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.29 
 
 		 371 aa  44.3  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  36.78 
 
 		 810 aa  44.3  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.09 
 
 		 765 aa  44.3  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  36.36 
 
 		 655 aa  44.3  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  33.33 
 
 		 364 aa  43.9  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>