More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0909 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 363 aa  726    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  90.36 
 
 		 363 aa  666    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  40.38 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  38.06 
 
 		 371 aa  278  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  40.77 
 
 		 376 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  41.36 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  41.71 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  41.37 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  42.11 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  40.28 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  42.69 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  41.64 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  39.34 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  38.57 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  41.87 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  41.87 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  41.87 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  40.29 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  40.61 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  40.72 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  40.61 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  40.61 
 
 		 371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  39.06 
 
 		 371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  39.06 
 
 		 371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  41.31 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  39.06 
 
 		 371 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  44.86 
 
 		 377 aa  266  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  40.61 
 
 		 371 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  42.86 
 
 		 370 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  42.86 
 
 		 370 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  40.16 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  40.33 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  41.43 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  39.61 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  39.55 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  39.32 
 
 		 371 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  42.86 
 
 		 374 aa  262  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 371 aa  262  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  41 
 
 		 370 aa  262  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  41.05 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  38.57 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  40.77 
 
 		 369 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  41.04 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  41.04 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  42.29 
 
 		 370 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  40 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  42.9 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  39.61 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  42.94 
 
 		 374 aa  258  8e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  39.43 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  44.17 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  38.86 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  41.03 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  40.83 
 
 		 372 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  41.81 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  40.61 
 
 		 365 aa  255  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  41.03 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  39.43 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  37.57 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  37.57 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  43.22 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  41.05 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  39.23 
 
 		 371 aa  252  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  42.57 
 
 		 371 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  40.29 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  40.5 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  41.64 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1793  alanine dehydrogenase  41.32 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000626319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  39.14 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  39.14 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  42 
 
 		 372 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  40.22 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  42.86 
 
 		 371 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  41.24 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1741  alanine dehydrogenase  41.71 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000121779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  42.86 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  42.86 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  39.31 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  39.61 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  43.35 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  40.4 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>