More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4362 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  78.09 
 
 		 713 aa  1111    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  79.89 
 
 		 722 aa  1142    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  66.05 
 
 		 719 aa  952    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  80 
 
 		 722 aa  1133    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1428    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  37.38 
 
 		 689 aa  428  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  39.49 
 
 		 707 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  34.44 
 
 		 680 aa  415  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  34.8 
 
 		 688 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  34.49 
 
 		 680 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 687 aa  396  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  34.49 
 
 		 707 aa  392  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  33.63 
 
 		 687 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1620  CoA-binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 694 aa  389  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0696581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1910  CoA-binding domain protein  34.71 
 
 		 676 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236564  normal  0.164304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  32.68 
 
 		 705 aa  361  2e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 704 aa  354  2e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1246  CoA-binding domain-containing protein  35.32 
 
 		 753 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000185124  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  40.17 
 
 		 714 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  39.04 
 
 		 696 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  39.31 
 
 		 711 aa  327  3e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  40.09 
 
 		 696 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  38.16 
 
 		 698 aa  310  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  37.44 
 
 		 697 aa  307  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  37.42 
 
 		 702 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  37.64 
 
 		 702 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  37.19 
 
 		 703 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  36.06 
 
 		 706 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  37.99 
 
 		 699 aa  303  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 698 aa  301  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  38.8 
 
 		 669 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  35.32 
 
 		 698 aa  294  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  37.06 
 
 		 700 aa  293  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 701 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.52 
 
 		 929 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  33.48 
 
 		 706 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  35.62 
 
 		 915 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 712 aa  275  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3442  CoA-binding domain protein  28.75 
 
 		 710 aa  273  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  33.27 
 
 		 883 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0319  CoA-binding domain protein  34.98 
 
 		 464 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1854  CoA-binding domain-containing protein  35.91 
 
 		 472 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.66 
 
 		 660 aa  270  8e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  33.56 
 
 		 892 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 		 918 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.49 
 
 		 699 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  34.32 
 
 		 911 aa  264  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  31.34 
 
 		 905 aa  263  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1093  CoA-binding domain-containing protein  34.71 
 
 		 477 aa  261  3e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  36.48 
 
 		 698 aa  261  4e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  33.33 
 
 		 912 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0484  CoA-binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 461 aa  260  7e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.833675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.86 
 
 		 892 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  34.03 
 
 		 920 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 		 709 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0586  CoA-binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 705 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 711 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  36.25 
 
 		 508 aa  253  1e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  32.71 
 
 		 895 aa  251  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1804  CoA-binding domain-containing protein  34.77 
 
 		 461 aa  250  8e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.688194  normal  0.0833486 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  33.72 
 
 		 699 aa  249  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  32.96 
 
 		 893 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  31.83 
 
 		 707 aa  247  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  35.62 
 
 		 660 aa  247  6e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  33.12 
 
 		 911 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  33.33 
 
 		 897 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 		 889 aa  244  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  34.32 
 
 		 907 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4996  CoA-binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 705 aa  243  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  34.56 
 
 		 704 aa  242  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  32.04 
 
 		 921 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  35.01 
 
 		 907 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  36.04 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.95 
 
 		 900 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 913 aa  238  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1635  CoA-binding domain-containing protein  32.9 
 
 		 461 aa  236  7e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1589  CoA-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 451 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  30.65 
 
 		 903 aa  233  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  31.88 
 
 		 697 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 		 907 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  37.4 
 
 		 904 aa  231  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  31.66 
 
 		 695 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  32.88 
 
 		 750 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1311  hypothetical protein  31.85 
 
 		 886 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1991  CoA-binding domain protein  30.16 
 
 		 711 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  30.45 
 
 		 693 aa  227  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0138  CoA-binding domain-containing protein  33.42 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0892765  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34.32 
 
 		 727 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 		 728 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2897  CoA-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 451 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  31.59 
 
 		 697 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  36.39 
 
 		 898 aa  221  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0978  CoA-binding domain-containing protein  32.8 
 
 		 375 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00209366  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  32.61 
 
 		 693 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.27 
 
 		 881 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  36.5 
 
 		 887 aa  218  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  30.29 
 
 		 926 aa  217  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 		 926 aa  217  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  31.19 
 
 		 893 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  37.68 
 
 		 976 aa  216  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>