25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3197 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  65.24 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  33.63 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  35.96 
 
 		 446 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  38.85 
 
 		 312 aa  94.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  30.23 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  48.89 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  36.09 
 
 		 395 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  35.23 
 
 		 735 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  35.15 
 
 		 389 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  36.02 
 
 		 387 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  35.23 
 
 		 735 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  34.34 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  35.9 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  40.17 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  35.9 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  35.9 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  36.54 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  34 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1006 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  32.16 
 
 		 758 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  37.97 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  37.36 
 
 		 703 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  34.44 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  39.81 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>