More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1266 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 262 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  46.9 
 
 		 258 aa  246  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.86 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.21 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.06 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.31 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.79 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  43.15 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 262 aa  174  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3825  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.47 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000788049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0977  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.43 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.11 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 		 281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  42.34 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.96 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.74 
 
 		 651 aa  159  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5119  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 267 aa  154  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.49 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.52 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  34.14 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  35.22 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1791  hypothetical protein  36.72 
 
 		 276 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1792  hypothetical protein  36.33 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1150  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2008  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.27 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>