24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3245 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 318 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  88.05 
 
 		 318 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.43 
 
 		 310 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.07 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  40.71 
 
 		 313 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.01 
 
 		 337 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  26.27 
 
 		 357 aa  89.4  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  27.44 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.02 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.74 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.85 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.78 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  28.67 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.64 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0240  hypothetical protein  23.62 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00126667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.52 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.32 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.32 
 
 		 1007 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.67 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.7 
 
 		 265 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.67 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  20.48 
 
 		 359 aa  42.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>