More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1397 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4065  ABC transporter related  79.47 
 
 		 505 aa  810    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0517348  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1632  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  80.04 
 
 		 486 aa  801    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1397  ABC transporter related  100 
 
 		 492 aa  999    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0472986  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1576  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  80.08 
 
 		 492 aa  808    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1814  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325907  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0812  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1103  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0455  ABC-type sugar transport system, ATPase component  54.77 
 
 		 493 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0360  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.97 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.77 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22100  ABC transporter protein  53.72 
 
 		 497 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  50.2 
 
 		 494 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2571  ABC transporter  52.34 
 
 		 495 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2046  ABC transporter related  52.44 
 
 		 489 aa  488  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0912  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  52.15 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3881  sugar transport ATP-binding protein  52.15 
 
 		 502 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0578526 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0966  ABC transporter related  52.15 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  48.37 
 
 		 494 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4583  ABC transporter related  51.63 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  49.79 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  46.26 
 
 		 524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  46.23 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  46.26 
 
 		 518 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  46.23 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  45.31 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  45.66 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  44.72 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  45.86 
 
 		 524 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  45.14 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 		 527 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  45.25 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  45.25 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  45.25 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  46.04 
 
 		 521 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  45.93 
 
 		 503 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 		 525 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  45.01 
 
 		 523 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  45.84 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  45.6 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.29 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.73 
 
 		 513 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  44.11 
 
 		 511 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  44.17 
 
 		 501 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 501 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 497 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.23 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.16 
 
 		 524 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.17 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  44.38 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  44.38 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  43.56 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  44.38 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  44.58 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  44.17 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.58 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  44.38 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  43.97 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  44.17 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  43.97 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  44.38 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.2 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  44.29 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  44.4 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  43.97 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.81 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  44.33 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.51 
 
 		 496 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  44.74 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  44.54 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  43.56 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  45.42 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  42.28 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  44.54 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.72 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  45.05 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  43.24 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.66 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  41.58 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  43.81 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  43.09 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.66 
 
 		 512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.4 
 
 		 508 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  41.89 
 
 		 496 aa  403  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.45 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  42.62 
 
 		 495 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 		 494 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  42.16 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.22 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  42.94 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>