29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5627 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5627  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 187 aa  362  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0178766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7226  peptidase A24A prepilin type IV  91.98 
 
 		 187 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.22284 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  30.71 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1819  peptidase A24A prepilin type IV  33.52 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.554319  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  32.34 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  30.92 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  31.09 
 
 		 145 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  38.78 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  34.48 
 
 		 175 aa  51.2  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  33.76 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  31.25 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0512  peptidase A24A prepilin type IV  31.58 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000304579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  33.58 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  35.58 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2111  peptidase A24A, prepilin type IV  31.03 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  32.06 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  26.4 
 
 		 247 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  25 
 
 		 247 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1114  peptidase A24A, prepilin type IV  37.89 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.33 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  34.71 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2010  peptidase A24A prepilin type IV  25 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  35.85 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  31.34 
 
 		 274 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  34.78 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.93 
 
 		 259 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  25 
 
 		 260 aa  42  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  37.5 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0545  prepilin peptidase CpaA  39.06 
 
 		 142 aa  40.8  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>