More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2276 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  91.78 
 
 
426 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  100 
 
 
426 aa  873    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  69.95 
 
 
431 aa  633  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  67.7 
 
 
439 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  64.79 
 
 
432 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  71.17 
 
 
296 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  71.33 
 
 
297 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  70.93 
 
 
307 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  70.98 
 
 
297 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  71.53 
 
 
310 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  69.64 
 
 
296 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  71.17 
 
 
316 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  68.9 
 
 
301 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  67.84 
 
 
303 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  66.78 
 
 
303 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  66.9 
 
 
303 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  66.08 
 
 
307 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  64.34 
 
 
302 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  62.63 
 
 
304 aa  362  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  58.72 
 
 
290 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  55.05 
 
 
289 aa  311  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  53 
 
 
289 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  52.45 
 
 
298 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  52.61 
 
 
288 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2680  beta-lactamase-like protein  72.86 
 
 
206 aa  302  8.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000091053 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  50.87 
 
 
292 aa  299  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  50.81 
 
 
307 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  51.57 
 
 
293 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  51.94 
 
 
286 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  52.28 
 
 
320 aa  296  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  50.18 
 
 
286 aa  295  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  50.51 
 
 
297 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  51.01 
 
 
300 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  53.36 
 
 
315 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  51.37 
 
 
294 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  51.4 
 
 
289 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  48.52 
 
 
307 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  50 
 
 
297 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  50 
 
 
293 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  51.25 
 
 
288 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1705  beta-lactamase domain protein  52.11 
 
 
286 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.739327 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  49.12 
 
 
295 aa  291  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  50.87 
 
 
294 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  51.05 
 
 
294 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  49.12 
 
 
295 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  52.6 
 
 
316 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  51.05 
 
 
294 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  50.87 
 
 
288 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  51.05 
 
 
289 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  49.83 
 
 
308 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  51.4 
 
 
294 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  50.35 
 
 
308 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  50.53 
 
 
306 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  50.35 
 
 
286 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  49.64 
 
 
296 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2013  beta-lactamase domain protein  51.41 
 
 
286 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439251  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  50.18 
 
 
288 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  50.35 
 
 
294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  50.71 
 
 
299 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0869  beta-lactamase domain-containing protein  48.58 
 
 
293 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.158714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  48.45 
 
 
294 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  49.12 
 
 
287 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  48.45 
 
 
294 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  48.45 
 
 
294 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1544  hypothetical protein  50.7 
 
 
286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
297 aa  284  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  48.8 
 
 
294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  50.35 
 
 
288 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3513  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106163  normal  0.808023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  49.13 
 
 
288 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  48.75 
 
 
298 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  48.94 
 
 
312 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6795  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  50.35 
 
 
297 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  50.9 
 
 
298 aa  280  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1299  putative metallo-beta-lactamase family protein  49.47 
 
 
286 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  48.14 
 
 
306 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.75 
 
 
299 aa  277  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  47.9 
 
 
289 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  47.7 
 
 
290 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3688  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  48.76 
 
 
295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  47.16 
 
 
294 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  47.42 
 
 
294 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  45.39 
 
 
300 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  45.39 
 
 
300 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.2 
 
 
294 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  45.04 
 
 
294 aa  268  8.999999999999999e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  46.31 
 
 
319 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  45.26 
 
 
287 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  45.86 
 
 
295 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  46.39 
 
 
308 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  45.23 
 
 
287 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.76 
 
 
290 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  45.39 
 
 
293 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  44.84 
 
 
297 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0946  beta-lactamase-like  44.33 
 
 
288 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  44.41 
 
 
290 aa  249  7e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1978  beta-lactamase domain-containing protein  44.17 
 
 
288 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2168  beta-lactamase-like protein  47.52 
 
 
284 aa  237  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583508  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3205  beta-lactamase domain-containing protein  46.69 
 
 
290 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568485  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  41.13 
 
 
284 aa  222  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>