More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0951 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 450 aa  914    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  92.44 
 
 		 458 aa  835    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  76.78 
 
 		 451 aa  695    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  55.5 
 
 		 456 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  41.44 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  43.91 
 
 		 466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  37.69 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  38.86 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  41.79 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  39.5 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  39.4 
 
 		 458 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  39.4 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  40.24 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  39.58 
 
 		 459 aa  288  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  38.48 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  38.48 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  38.52 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  40.65 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  38.28 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  38.48 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  37.59 
 
 		 472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  38.71 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  38.25 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  38.05 
 
 		 458 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  38.71 
 
 		 458 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  37.24 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  38.99 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  37.82 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  37.5 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  37.5 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  37.5 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  40.83 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  40.83 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  37.79 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  37.26 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  37.26 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  37.26 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  37.26 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  38.85 
 
 		 460 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  40.83 
 
 		 445 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  37.03 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  37.96 
 
 		 460 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  37.65 
 
 		 472 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  39.57 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  36.79 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  37.73 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  37.73 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  36.03 
 
 		 455 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  41.29 
 
 		 479 aa  260  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  33.56 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  37.01 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  36.55 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  36.78 
 
 		 464 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  36.55 
 
 		 468 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  36.55 
 
 		 455 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  36.7 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  36.87 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  36.47 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  36.47 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  36.24 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  36.18 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  37.84 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  36.18 
 
 		 471 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  34.79 
 
 		 455 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  34.79 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  36.59 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  36.03 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  36.03 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  36.03 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  36.03 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  35.8 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  35.8 
 
 		 490 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  35.4 
 
 		 456 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  35.57 
 
 		 445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  35.24 
 
 		 445 aa  232  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35.48 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  35.55 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35.48 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.48 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  35.47 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  35.71 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  33.94 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  35.47 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  35.84 
 
 		 448 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  35.39 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2031  glutamate--ammonia ligase  34.66 
 
 		 451 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  34.47 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0377  L-glutamine synthetase  34.66 
 
 		 451 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  34.09 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  35.39 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  35.19 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  33.86 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  33.86 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3013  glutamate--putrescine ligase  35.62 
 
 		 445 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  33.57 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2380  glutamate--ammonia ligase  35.47 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  34.38 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2994  glutamate--ammonia ligase  35.47 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  32.87 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>