113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3660 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3660  carbamoyltransferase  100 
 
 		 563 aa  1163    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4991  carbamoyltransferase  62.99 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1487  3'-hydroxymethylcephem-O-carbamoyltransferase protein  46.49 
 
 		 523 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7715  carbamoyltransferase  29.78 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339505  normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  34.5 
 
 		 591 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  33.8 
 
 		 609 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  33.8 
 
 		 609 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  34.17 
 
 		 599 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  41.15 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  39.84 
 
 		 572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  42.86 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  36.8 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  38.19 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  38.22 
 
 		 606 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  36.39 
 
 		 581 aa  164  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  38.43 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  40.38 
 
 		 581 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  38.31 
 
 		 581 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  38.31 
 
 		 581 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  38.31 
 
 		 581 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  39.34 
 
 		 546 aa  158  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  33.71 
 
 		 584 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  33.71 
 
 		 584 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  33.71 
 
 		 584 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  33.71 
 
 		 584 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  33.15 
 
 		 584 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  33.71 
 
 		 584 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  33.15 
 
 		 584 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  38.46 
 
 		 584 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  38.46 
 
 		 581 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  34.38 
 
 		 592 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  37.75 
 
 		 551 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4492  carbamoyl transferase NodU family-like protein  34.7 
 
 		 649 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4989  hypothetical protein  56.1 
 
 		 123 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  28.82 
 
 		 551 aa  147  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  34.84 
 
 		 623 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  37.09 
 
 		 545 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  38.78 
 
 		 601 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  35.29 
 
 		 605 aa  144  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  39.34 
 
 		 563 aa  143  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  36.54 
 
 		 620 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  26.55 
 
 		 567 aa  141  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  33.81 
 
 		 541 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  27.24 
 
 		 573 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  27.64 
 
 		 573 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  33.52 
 
 		 651 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  27.24 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  35.77 
 
 		 618 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  34.71 
 
 		 633 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  35.77 
 
 		 669 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  33.58 
 
 		 572 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  35.74 
 
 		 606 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  35.1 
 
 		 603 aa  135  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  27.87 
 
 		 578 aa  134  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  34.21 
 
 		 595 aa  133  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  36.84 
 
 		 690 aa  133  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2934  Carbamoyltransferase  27.14 
 
 		 522 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3355  carbamoyltransferase  26.72 
 
 		 656 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.731341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  33.68 
 
 		 620 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  35.07 
 
 		 587 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  35.09 
 
 		 589 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  27.13 
 
 		 579 aa  130  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  35.98 
 
 		 585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  34.15 
 
 		 621 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  35.11 
 
 		 589 aa  127  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  34.15 
 
 		 620 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  34.46 
 
 		 613 aa  127  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  34.46 
 
 		 669 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  36.59 
 
 		 584 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  33.33 
 
 		 591 aa  125  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  35.11 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  37.76 
 
 		 678 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  31.18 
 
 		 584 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  31.6 
 
 		 670 aa  120  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  33.1 
 
 		 594 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  30.69 
 
 		 548 aa  120  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  32.96 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  35.4 
 
 		 622 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  30.74 
 
 		 585 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  31.07 
 
 		 585 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  31.23 
 
 		 617 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  30.74 
 
 		 585 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  30.74 
 
 		 585 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  31.15 
 
 		 618 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  28.9 
 
 		 585 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  31.18 
 
 		 585 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  29.37 
 
 		 619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  31.9 
 
 		 585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  30.37 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  39.52 
 
 		 574 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  33.46 
 
 		 610 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  31.43 
 
 		 585 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  34.14 
 
 		 657 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  29.7 
 
 		 619 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  29.59 
 
 		 597 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  33.09 
 
 		 613 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  31.12 
 
 		 584 aa  114  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43222  predicted protein  32.31 
 
 		 919 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  24.76 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  32.63 
 
 		 612 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>