More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2317 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 		 253 aa  524  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  74.6 
 
 		 253 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  72.51 
 
 		 267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  72.51 
 
 		 267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  74.9 
 
 		 267 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  71.31 
 
 		 252 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  72.29 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  66.53 
 
 		 256 aa  363  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  63.49 
 
 		 255 aa  357  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  62.55 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  55.24 
 
 		 255 aa  304  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  46.67 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  47.13 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  36.71 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 		 302 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  33.03 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  33.2 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  36.07 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  32.79 
 
 		 307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  31.93 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  32.26 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  31.51 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  30.67 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  32.77 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  34.82 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  31.17 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.64 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  33.76 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  33.05 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  36.65 
 
 		 463 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  31.54 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  29.83 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 		 462 aa  99.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.57 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  36.28 
 
 		 466 aa  99  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 		 304 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  29.96 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  30.17 
 
 		 394 aa  98.2  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  34.4 
 
 		 305 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  35.24 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  35.05 
 
 		 416 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  30.29 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.41 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  29.92 
 
 		 597 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  36.36 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  34.08 
 
 		 519 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  34.55 
 
 		 477 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.18 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  35.45 
 
 		 449 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  31.73 
 
 		 548 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  37.05 
 
 		 389 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  31.23 
 
 		 574 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.52 
 
 		 611 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  33.64 
 
 		 301 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  30.23 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  35.55 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  34.11 
 
 		 421 aa  95.5  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  28.04 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  34.11 
 
 		 422 aa  95.1  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  32.6 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  32.13 
 
 		 554 aa  94.4  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  31.63 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.56 
 
 		 438 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  33.73 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.07 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  33.94 
 
 		 469 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  34.42 
 
 		 505 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  34.91 
 
 		 474 aa  92  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  32.09 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  32.39 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  27.83 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.11 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.56 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  31.85 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  31.63 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 		 404 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  32.66 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3842  protein serine/threonine phosphatase  31.16 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104123  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  33.78 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.28 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.13 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4063  protein serine/threonine phosphatase  31.45 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000181266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  30.65 
 
 		 323 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  29.22 
 
 		 386 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  30.7 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.82 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  30.66 
 
 		 567 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 472 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  36.57 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  33.03 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.42 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  30.37 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  33.33 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  30.37 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.25 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  33.17 
 
 		 467 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>