More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0429 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0429  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 		 111 aa  231  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3476  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.71 
 
 		 291 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00429307  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  39.05 
 
 		 415 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  54.84 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.84 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1987  heat shock protein DnaJ domain protein  34.75 
 
 		 424 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.657228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  54.84 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  54.84 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  54.84 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2053  chaperone protein DnaJ  53.12 
 
 		 378 aa  64.7  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.519265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 		 387 aa  63.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 		 374 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  54.84 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 		 395 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.61 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 		 388 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 		 374 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  46.27 
 
 		 298 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  49.28 
 
 		 379 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1823  heat shock protein DnaJ-like protein  46.58 
 
 		 345 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0279847  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  52.38 
 
 		 373 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  49.28 
 
 		 330 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2086  DnaJ domain-containing protein  52.46 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000110327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  52.46 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 		 386 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 		 355 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0511  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 378 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.100964  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 		 372 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  54.84 
 
 		 340 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2614  heat shock protein DnaJ domain protein  45.35 
 
 		 292 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1999  heat shock protein DnaJ  42.5 
 
 		 394 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  49.21 
 
 		 386 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  52.46 
 
 		 316 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  47.54 
 
 		 307 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  51.61 
 
 		 379 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.83 
 
 		 330 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  47.83 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  51.61 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1299  chaperone protein DnaJ  44.26 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  50 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.39 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  46.48 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1208  heat shock protein DnaJ domain protein  42.42 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  51.47 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.39 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1382  heat shock protein DnaJ domain protein  51.56 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.995337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  53.23 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 		 385 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  50.82 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1135  heat shock protein DnaJ-like  47.22 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.379333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 398 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  51.61 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 400 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 		 384 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1972  chaperone protein DnaJ  52.46 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000781589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1443  DNAJ class chaperone; heat shock protein  40.24 
 
 		 402 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2235  chaperone protein DnaJ  52.46 
 
 		 375 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0177525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 404 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 395 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  50 
 
 		 396 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  46.38 
 
 		 377 aa  57.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 		 395 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4231  chaperone DnaJ domain protein  46.97 
 
 		 349 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  51.61 
 
 		 326 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.77 
 
 		 325 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  52.46 
 
 		 301 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0778  co-chaperone-curved DNA binding protein A  46.25 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  46.77 
 
 		 325 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 		 381 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.61 
 
 		 287 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  45.9 
 
 		 276 aa  57.8  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  51.61 
 
 		 335 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.61 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  47.76 
 
 		 325 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5621  predicted protein  47.76 
 
 		 323 aa  57.8  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00931047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2664  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 375 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2290  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 375 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  48.39 
 
 		 339 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  54.39 
 
 		 383 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  46.97 
 
 		 314 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 379 aa  57  0.00000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  52.31 
 
 		 377 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05510  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  47.69 
 
 		 361 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.731884  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03375  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01230)  47.06 
 
 		 466 aa  57  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.698217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  45 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2103  heat shock protein DnaJ domain protein  54.1 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000586336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  48.39 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.364765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>