221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0122 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0122  carboxylesterase  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  77.58 
 
 
286 aa  454  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2291  S-formylglutathione hydrolase  73.7 
 
 
294 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2801  carboxylesterase  73.36 
 
 
294 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.234504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5934  carboxylesterase  72.4 
 
 
282 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.304704  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0694  S-formylglutathione hydrolase  72.5 
 
 
282 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.816955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2413  S-formylglutathione hydrolase  72.89 
 
 
290 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2627  S-formylglutathione hydrolase  71.33 
 
 
282 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1993  carboxylesterase  72.04 
 
 
282 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2651  carboxylesterase  72.04 
 
 
282 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2603  carboxylesterase  72.04 
 
 
282 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2524  S-formylglutathione hydrolase  72.4 
 
 
282 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225567  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0325  esterase, putative  72.04 
 
 
286 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1026  S-formylglutathione hydrolase  72.4 
 
 
286 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0623  putative esterase  72.04 
 
 
286 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.778268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2457  putative esterase  72.04 
 
 
286 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0863  S-formylglutathione hydrolase  72.4 
 
 
286 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0867  S-formylglutathione hydrolase  72.4 
 
 
286 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0071  putative esterase  72.04 
 
 
286 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3999  carboxylesterase  70.46 
 
 
283 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0687  esterase, putative  70.61 
 
 
282 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1701  S-formylglutathione hydrolase  73.08 
 
 
291 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0714  S-formylglutathione hydrolase (FghA)  69.82 
 
 
285 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4785  S-formylglutathione hydrolase  69.86 
 
 
282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0295503  normal  0.699592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3256  S-formylglutathione hydrolase  72.86 
 
 
288 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0484  S-formylglutathione hydrolase  67.86 
 
 
281 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329572  hitchhiker  0.0024188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3252  S-formylglutathione hydrolase  68.79 
 
 
283 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.499772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0604  hydrolase oxidoreductase protein  71.43 
 
 
289 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2194  carboxylesterase  65.97 
 
 
289 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0521  S-formylglutathione hydrolase  71.53 
 
 
287 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0534  S-formylglutathione hydrolase  71.53 
 
 
287 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2496  S-formylglutathione hydrolase  63.25 
 
 
280 aa  354  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.881177  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0756  S-formylglutathione hydrolase  58.78 
 
 
282 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0002  carboxylesterase  59.5 
 
 
283 aa  338  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1087  putative esterase  55.91 
 
 
278 aa  329  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2452  S-formylglutathione hydrolase  57.71 
 
 
279 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243797  normal  0.206976 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0698  S-formylglutathione hydrolase  57.95 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.380863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  57.45 
 
 
283 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1511  S-formylglutathione hydrolase  56.38 
 
 
283 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0807  carboxylesterase  57.35 
 
 
281 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179435  hitchhiker  0.00571706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3406  carboxylesterase  56.99 
 
 
282 aa  315  8e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2312  S-formylglutathione hydrolase  58.21 
 
 
280 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.770707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0607  S-formylglutathione hydrolase  56.27 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0986  carboxylesterase  54.39 
 
 
285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38740  S-formylglutathione hydrolase  57.65 
 
 
281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1126  putative esterase  54.96 
 
 
281 aa  311  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2412  S-formylglutathione hydrolase  57.3 
 
 
281 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4638  S-formylglutathione hydrolase  50.71 
 
 
283 aa  308  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.186695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0257  Fis family transcriptional regulator  52.48 
 
 
281 aa  308  6.999999999999999e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1171  S-formylglutathione hydrolase  54.26 
 
 
284 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.441797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0080  S-formylglutathione hydrolase  58.39 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00557282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0270  S-formylglutathione hydrolase  53.74 
 
 
279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1617  S-formylglutathione hydrolase  53.9 
 
 
284 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117906  normal  0.524398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4160  S-formylglutathione hydrolase  53.9 
 
 
284 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.394545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4058  S-formylglutathione hydrolase  54.26 
 
 
284 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3679  S-formylglutathione hydrolase  53.41 
 
 
276 aa  304  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.277984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2838  carboxylesterase  50.71 
 
 
282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.796702  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3385  S-formylglutathione hydrolase  55.93 
 
 
276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0846  S-formylglutathione hydrolase  58.11 
 
 
268 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.923853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04413  S-formylglutathione hydrolase  54.12 
 
 
276 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0376  S-formylglutathione hydrolase  52.5 
 
 
289 aa  301  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4058  carboxylesterase  52.86 
 
 
281 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.863948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1087  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 
283 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1116  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 
283 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.85145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3426  carboxylesterase  53.21 
 
 
279 aa  299  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1541  carboxylesterase  51.97 
 
 
278 aa  299  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.107015  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3945  S-formylglutathione hydrolase  54.8 
 
 
276 aa  298  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3027  carboxylesterase  54.45 
 
 
280 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0003  carboxylesterase  51.07 
 
 
281 aa  298  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000930  S-formylglutathione hydrolase  52.48 
 
 
279 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3515  S-formylglutathione hydrolase  52.48 
 
 
278 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0051  periplasmic nitrate reductase, large subunit  53.76 
 
 
280 aa  296  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1439  carboxylesterase  51.59 
 
 
285 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0105  S-formylglutathione hydrolase  51.25 
 
 
276 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0160  esterase, putative  52.86 
 
 
279 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.471398  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06926  esterase  51.06 
 
 
279 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2252  carboxylesterase  53.93 
 
 
283 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.493434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2273  carboxylesterase  52.46 
 
 
289 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0019  carboxylesterase  52.5 
 
 
279 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0458  carboxylesterase  55.87 
 
 
278 aa  292  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4226  carboxylesterase  52.14 
 
 
279 aa  292  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0152295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4239  S-formylglutathione hydrolase  51.6 
 
 
276 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0819  putative esterase  51.25 
 
 
283 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1666  S-formylglutathione hydrolase  54.26 
 
 
281 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3766  carboxylesterase  50 
 
 
279 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3531  carboxylesterase  48.58 
 
 
283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2755  carboxylesterase  53.21 
 
 
278 aa  288  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.936506  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1559  esterase, putative  52.67 
 
 
281 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.41528  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2055  esterase, putative  50.36 
 
 
279 aa  287  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0099  carboxylesterase  53.21 
 
 
281 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2407  S-formylglutathione hydrolase  51.44 
 
 
280 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1937  S-formylglutathione hydrolase  53.36 
 
 
280 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446926  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2418  S-formylglutathione hydrolase  51.8 
 
 
280 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5942  S-formylglutathione hydrolase  50.71 
 
 
281 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2525  S-formylglutathione hydrolase  51.44 
 
 
280 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1368  carboxylesterase  51.6 
 
 
281 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1393  carboxylesterase  51.25 
 
 
281 aa  285  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0228664  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  53 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1941  S-formylglutathione hydrolase  51.44 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00373445  normal  0.789535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1177  S-formylglutathione hydrolase  53.02 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>