More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5508 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  914    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  47.54 
 
 
487 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  47.06 
 
 
451 aa  332  8e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  43.08 
 
 
461 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  41.13 
 
 
456 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  35.88 
 
 
466 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  36.61 
 
 
445 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  35.9 
 
 
466 aa  222  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  35.24 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  39.67 
 
 
428 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  36.95 
 
 
419 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  35.02 
 
 
520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  32.72 
 
 
459 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  31.2 
 
 
501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  32.97 
 
 
466 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  32.73 
 
 
480 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  33.05 
 
 
490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  35.12 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  29.47 
 
 
451 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  33.02 
 
 
504 aa  142  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.59 
 
 
432 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  33.25 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  28.87 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.91 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  32.04 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.85 
 
 
446 aa  116  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  26.18 
 
 
431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.83 
 
 
434 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.74 
 
 
476 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  27.09 
 
 
462 aa  107  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.26 
 
 
469 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.74 
 
 
476 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.74 
 
 
500 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.74 
 
 
447 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.51 
 
 
470 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  26.67 
 
 
434 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.62 
 
 
445 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  27.65 
 
 
455 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.74 
 
 
451 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.74 
 
 
484 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5797  amidohydrolase  26.62 
 
 
491 aa  103  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.61 
 
 
470 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2253  amidohydrolase  24.51 
 
 
437 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.43 
 
 
448 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.48 
 
 
452 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.79 
 
 
465 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  27.36 
 
 
448 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.4 
 
 
439 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.57 
 
 
465 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.43 
 
 
446 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.07 
 
 
457 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  25.12 
 
 
432 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.06 
 
 
470 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.06 
 
 
470 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.06 
 
 
470 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0417  amidohydrolase  26.03 
 
 
483 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.83 
 
 
470 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  25.76 
 
 
431 aa  100  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  27.75 
 
 
457 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  31.18 
 
 
451 aa  99.8  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.44 
 
 
453 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  24.59 
 
 
462 aa  99.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  27.25 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  25.62 
 
 
462 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.39 
 
 
470 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.08 
 
 
452 aa  97.4  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.19 
 
 
493 aa  97.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  26.65 
 
 
440 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.56 
 
 
431 aa  97.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.54 
 
 
465 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.54 
 
 
465 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  30.32 
 
 
444 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.32 
 
 
470 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.35 
 
 
454 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  23.67 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  29.3 
 
 
474 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.64 
 
 
442 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.25 
 
 
428 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.4 
 
 
430 aa  94  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.48 
 
 
472 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  28.8 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  26.01 
 
 
449 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  26.21 
 
 
479 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.33 
 
 
467 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.02 
 
 
461 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  28.03 
 
 
460 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  26.41 
 
 
464 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_003296  RS03928  hydrolase transmembrane protein  25.13 
 
 
476 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  22.32 
 
 
435 aa  92  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.69 
 
 
454 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  26.87 
 
 
443 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  26.71 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  27.62 
 
 
477 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  24.94 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  24.5 
 
 
440 aa  90.9  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 
464 aa  90.5  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  23.22 
 
 
436 aa  90.1  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  25.39 
 
 
447 aa  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  25.61 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  26.46 
 
 
466 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>