More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4743 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  100 
 
 		 305 aa  617  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  86.23 
 
 		 305 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  85.57 
 
 		 305 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  84.59 
 
 		 305 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  84.26 
 
 		 306 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  84.31 
 
 		 306 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  83.22 
 
 		 307 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  85.9 
 
 		 321 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  81.64 
 
 		 305 aa  501  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  81.64 
 
 		 305 aa  501  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  79.34 
 
 		 306 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  76.39 
 
 		 305 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  78.62 
 
 		 305 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  75.99 
 
 		 305 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  76.32 
 
 		 305 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  73.18 
 
 		 302 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  62 
 
 		 306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  62.71 
 
 		 302 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58.14 
 
 		 312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  56.48 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  59.33 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.85 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.85 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  53.36 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  55.7 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  58.67 
 
 		 308 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  56.48 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  54.52 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  54.61 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  52.67 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  52.33 
 
 		 302 aa  292  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  55.92 
 
 		 309 aa  292  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  54.13 
 
 		 324 aa  291  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  53.87 
 
 		 307 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  54.28 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  52.33 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  55 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  55 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.31 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  53.8 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  53.29 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  55 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  54.88 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  56.76 
 
 		 308 aa  285  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  54.85 
 
 		 309 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  47.84 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  55.18 
 
 		 309 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  54.64 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  55.18 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  52.15 
 
 		 306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  54 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  50.32 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  56.08 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  54.88 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  51.82 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  57.72 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  53.87 
 
 		 307 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  49.33 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  52.96 
 
 		 307 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  53.87 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  53.87 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  53.87 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  53.87 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 309 aa  280  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  53.49 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  50.83 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  53.87 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  52.61 
 
 		 330 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  53.8 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  50.33 
 
 		 311 aa  279  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  53.87 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  51.51 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  53.59 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  53.62 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  52.81 
 
 		 309 aa  276  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  53.97 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  51.16 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  52.81 
 
 		 309 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  51.48 
 
 		 311 aa  275  8e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  54.46 
 
 		 310 aa  275  9e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  49.5 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  54.88 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  52.35 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0325  cysteine synthase K/M/A  56.21 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  54.36 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  52.94 
 
 		 313 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  51.46 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  52.35 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  51.31 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  52.48 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  52.12 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  52.32 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  48.68 
 
 		 307 aa  272  6e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 305 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  52.94 
 
 		 317 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  52.32 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 305 aa  271  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  53.14 
 
 		 309 aa  271  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  52.48 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  49.83 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>