More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4500 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  315  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  90.45 
 
 
157 aa  289  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  80 
 
 
164 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  80 
 
 
164 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  80 
 
 
164 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  80 
 
 
155 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  80 
 
 
155 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  80 
 
 
155 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  80 
 
 
155 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  78.81 
 
 
157 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  78.81 
 
 
157 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  78.15 
 
 
157 aa  244  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  78.15 
 
 
157 aa  243  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  78.15 
 
 
157 aa  243  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  78.15 
 
 
157 aa  243  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  75.64 
 
 
157 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  65.81 
 
 
158 aa  225  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 
156 aa  150  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  49.02 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 
162 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 
162 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
173 aa  137  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.75 
 
 
162 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
152 aa  133  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  43.9 
 
 
165 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 
167 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  43.31 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  43.95 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 
166 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
158 aa  127  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
157 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 
157 aa  126  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  41.45 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
154 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
161 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
161 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
161 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
161 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
161 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
181 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
161 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
161 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
152 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
177 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
156 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
157 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
165 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  41.45 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 
161 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
156 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 
161 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
155 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  41.45 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 
157 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  48.68 
 
 
189 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 
155 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  41.45 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  41.45 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
154 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
155 aa  121  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
168 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>