34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4381 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  100 
 
 		 308 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  62.22 
 
 		 170 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  49.12 
 
 		 174 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  58.75 
 
 		 178 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3339  transport-associated  45.87 
 
 		 198 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6404  transport-associated  56.1 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0981375  normal  0.190645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5656  transport-associated  56.1 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22123  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6031  transport-associated  54.02 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1389  transport-associated  54.02 
 
 		 287 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0291894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6440  transport-associated  54.02 
 
 		 287 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  52.63 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5436  transport-associated protein  56.58 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  56.41 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  46.73 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  56.41 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  56.41 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4591  transport-associated protein  48.24 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4375  transport-associated protein  43.01 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291836  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1714  transport-associated  48.94 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  52.56 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  51.9 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  47.44 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  50.63 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  45.05 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1715  transport-associated  41.03 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.487712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3206  transport-associated  38.32 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  34.44 
 
 		 115 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  29.69 
 
 		 412 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  47.83 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  35.44 
 
 		 106 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  35.56 
 
 		 118 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  44 
 
 		 119 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  44.44 
 
 		 144 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  42 
 
 		 119 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>