195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1082 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1082  gluconate kinase  100 
 
 
168 aa  345  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  85.26 
 
 
171 aa  276  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  60.51 
 
 
169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  59.48 
 
 
169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  57.41 
 
 
165 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  57.96 
 
 
169 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  58.49 
 
 
164 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3367  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  56.79 
 
 
165 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.000000649904 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1220  thermoresistant gluconokinase  55.15 
 
 
173 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0180  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  56.33 
 
 
167 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0663  carbohydrate kinase  56.33 
 
 
167 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2720  carbohydrate kinase  56.6 
 
 
167 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0630  carbohydrate kinase  56.33 
 
 
167 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3749  gluconate kinase  55.7 
 
 
167 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0558  carbohydrate kinase  55.35 
 
 
167 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0584  carbohydrate kinase  55.35 
 
 
167 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170664  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2443  thermoresistant gluconokinase  53.94 
 
 
172 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0242  gluconate kinase  60.26 
 
 
161 aa  185  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0359  thermoresistant gluconokinase  53.94 
 
 
172 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1217  thermoresistant gluconokinase  53.94 
 
 
172 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3403  putative thermoresistant gluconokinase  53.94 
 
 
172 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3437  putative thermoresistant gluconokinase  53.94 
 
 
172 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2628  thermoresistant gluconokinase  53.94 
 
 
172 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0043609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3439  shikimate kinase  53.66 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0352  thermoresistant gluconokinase  51.61 
 
 
168 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.947295  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0983  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.4 
 
 
165 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0150853  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3674  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  52.83 
 
 
180 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.9 
 
 
176 aa  154  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2732  gluconate kinase  47.1 
 
 
170 aa  153  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689831  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1135  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.57 
 
 
181 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0310526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3436  carbohydrate kinase  50.97 
 
 
166 aa  151  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  50.63 
 
 
178 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3528  gluconate kinase  48.17 
 
 
181 aa  150  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0830  carbohydrate kinase  50.67 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2114  gluconate kinase  52.26 
 
 
170 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.59 
 
 
161 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.59 
 
 
161 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.17 
 
 
200 aa  147  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4889  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.87 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3478  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  51.3 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1404  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  46.15 
 
 
627 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.214778  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.73 
 
 
167 aa  145  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  55.64 
 
 
182 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4858  gluconate kinase  47.33 
 
 
155 aa  143  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19412  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  47.1 
 
 
181 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3644  carbohydrate kinase  46.84 
 
 
162 aa  141  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.03 
 
 
182 aa  141  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  47.13 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  49.68 
 
 
429 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0365  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.43 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3273  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  46.39 
 
 
178 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52.59 
 
 
207 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2124  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.54 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0770  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  49.33 
 
 
159 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  44.65 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  44.87 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  48.72 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  47.4 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3888  gluconate kinase 1  44.65 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.15 
 
 
208 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  44.65 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2645  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  44.23 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  44.65 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4753  gluconate kinase 1  44.65 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.986563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3636  gluconate kinase 1  44.65 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3915  gluconate kinase 1  44.65 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  44.03 
 
 
186 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  42.14 
 
 
175 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.518112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24180  gluconate kinase  46.79 
 
 
174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.0373923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4497  gluconate kinase 1  43.03 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0404487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  52.21 
 
 
198 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.71 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1852  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  50.32 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.2 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.3 
 
 
759 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  47.92 
 
 
779 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  40 
 
 
174 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  47.37 
 
 
167 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.65 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.85 
 
 
178 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  47.37 
 
 
167 aa  127  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  47.37 
 
 
167 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2936  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  44.87 
 
 
177 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.76 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  47.79 
 
 
175 aa  127  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  46.5 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  42.11 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  44.38 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3731  gluconate kinase 1  43.87 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0473  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.2 
 
 
200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3851  gluconate kinase 1  43.87 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  40.52 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3809  gluconate kinase 1  43.87 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.15 
 
 
163 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0278  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.87 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0276  gluconate kinase 1  43.87 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3463  carbohydrate kinase  43.95 
 
 
180 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.53 
 
 
178 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  51.91 
 
 
167 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3911  gluconate kinase 1  43.23 
 
 
164 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.652303 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>