More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3988 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  92.78 
 
 		 263 aa  478  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  65.64 
 
 		 241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  52.97 
 
 		 266 aa  266  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  50.63 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  39.37 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  41.8 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  35.04 
 
 		 469 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  36.52 
 
 		 470 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  48.08 
 
 		 426 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  37.07 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  37.07 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  37.21 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  37.21 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  36.68 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  37.61 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  37.24 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  42.45 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  32.46 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  31.4 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  39.57 
 
 		 241 aa  99.4  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  29.1 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  29.19 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  41.18 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  30.77 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  30.77 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  39.23 
 
 		 283 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  35.76 
 
 		 211 aa  86.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  31.46 
 
 		 286 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  27.78 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  44.29 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  42.62 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  30.99 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  30.99 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  33.55 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  30.96 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  34.05 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  30.96 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  30.65 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  29.56 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  25.72 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  29.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  25.72 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  29.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  29.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  29.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  37.1 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  34.71 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  29.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  29.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  29.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02457  putative transposase  32.04 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  29.33 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  29.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  29.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  29.82 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  29.82 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1741  primosomal protein DnaI  27.67 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1775  primosomal protein DnaI  27.67 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  26.48 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  25.36 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  25.36 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  25.36 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  25.36 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  30.13 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  30.13 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  25.36 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  26.48 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  30.25 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  31.11 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  28.29 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  28.29 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  28.29 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  29.82 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  28.29 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  28.29 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  25.56 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  27.37 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  31.91 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  37.5 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  30.45 
 
 		 694 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  34.62 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  35.88 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5070  IstB ATP binding domain-containing protein  31.9 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0796  primosomal protein DnaI  31.62 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  27.59 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  34.62 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1309  IstB domain protein ATP-binding protein  28.83 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0360  IstB domain protein ATP-binding protein  28.83 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1892  IstB domain protein ATP-binding protein  28.83 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0595448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4251  IstB domain protein ATP-binding protein  28.83 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  32.57 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  28.23 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  30.19 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  34.68 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  31.97 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>