More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1892 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1309  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1892  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0595448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4251  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0360  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  81.93 
 
 
694 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3872  IstB domain protein ATP-binding protein  66.4 
 
 
263 aa  347  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  0.0551176 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  37.24 
 
 
275 aa  174  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1792  putative transposase-related ATP-binding protein  40.33 
 
 
262 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0585373  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  39.09 
 
 
262 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  39.09 
 
 
262 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  39.09 
 
 
262 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4904  IstB ATP binding domain-containing protein  38.68 
 
 
262 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4736  IstB ATP binding domain-containing protein  38.68 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2512  IstB ATP binding domain-containing protein  38.68 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.931109 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5654  IstB ATP binding domain-containing protein  38.68 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6528  IstB domain protein ATP-binding protein  37.45 
 
 
262 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0198  IstB domain protein ATP-binding protein  37.45 
 
 
262 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  29.61 
 
 
252 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  36.51 
 
 
286 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  36.51 
 
 
286 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  29.13 
 
 
263 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  35.54 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  35.54 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  35.54 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  35.04 
 
 
262 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  35.04 
 
 
262 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  32.91 
 
 
259 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  32.91 
 
 
259 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  34.84 
 
 
266 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  34.31 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0216  IstB domain protein ATP-binding protein  29.69 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.488281  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6479  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1051  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2873  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4857  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232299  hitchhiker  0.00902527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2938  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333111  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0944  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4854  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.640312  hitchhiker  0.00176569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1096  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1588  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1064  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2910  IstB domain protein ATP-binding protein  36.19 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  36.67 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1129  IstB domain protein ATP-binding protein  36.19 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  30.77 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  29.41 
 
 
252 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  29.41 
 
 
252 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  29.41 
 
 
252 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  29.41 
 
 
252 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  32.79 
 
 
285 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  31.03 
 
 
251 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  30.77 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  31.98 
 
 
285 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  31.98 
 
 
285 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  29.06 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  31.97 
 
 
291 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  29.66 
 
 
245 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  31.97 
 
 
291 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  28.09 
 
 
259 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  31.97 
 
 
291 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  31.97 
 
 
291 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  31.97 
 
 
291 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  31.97 
 
 
291 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  31.97 
 
 
291 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  31.97 
 
 
291 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  31.97 
 
 
291 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  28.09 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  28.09 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  31.2 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5849  IstB domain protein ATP-binding protein  30.87 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  31.2 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0835  IstB ATP binding domain-containing protein  30.74 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1341  IstB ATP binding domain-containing protein  30.74 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.37984  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2444  IstB ATP binding domain-containing protein  30.74 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.751325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3085  IstB ATP binding domain-containing protein  30.74 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.854683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4884  IstB-like ATP-binding protein  31.62 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3281  IstB ATP binding domain-containing protein  31.09 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  31.69 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  31.36 
 
 
246 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2467  IstB ATP binding domain-containing protein  29.54 
 
 
269 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2089  IstB domain protein ATP-binding protein  29.92 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3158  IstB domain protein ATP-binding protein  29.92 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  32.47 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  32.47 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  32.47 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  28.57 
 
 
249 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  32.35 
 
 
246 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  30.96 
 
 
264 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  30.96 
 
 
264 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2292  IstB domain protein ATP-binding protein  29.74 
 
 
254 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0259  IstB domain protein ATP-binding protein  29.74 
 
 
254 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  30.96 
 
 
264 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2088  IstB domain protein ATP-binding protein  29.74 
 
 
254 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  30.96 
 
 
264 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  30.96 
 
 
264 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  30.96 
 
 
264 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  30.96 
 
 
264 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4681  IstB ATP binding domain-containing protein  31.09 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  32.07 
 
 
250 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  30.71 
 
 
248 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>