More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3872 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3872  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
263 aa  540  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  0.0551176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  67.2 
 
 
694 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1892  IstB domain protein ATP-binding protein  66.4 
 
 
253 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0595448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0360  IstB domain protein ATP-binding protein  66.4 
 
 
253 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4251  IstB domain protein ATP-binding protein  66.4 
 
 
253 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1309  IstB domain protein ATP-binding protein  66.4 
 
 
253 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  39.22 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  39.2 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  39.2 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  39.2 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4904  IstB ATP binding domain-containing protein  39.92 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1792  putative transposase-related ATP-binding protein  39.42 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0585373  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0198  IstB domain protein ATP-binding protein  37.76 
 
 
262 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6528  IstB domain protein ATP-binding protein  37.76 
 
 
262 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  33.48 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5654  IstB ATP binding domain-containing protein  37.7 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2512  IstB ATP binding domain-containing protein  37.7 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.931109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4736  IstB ATP binding domain-containing protein  37.7 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  37.7 
 
 
286 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  37.7 
 
 
286 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  33.48 
 
 
263 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  37.77 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  37.77 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  35.95 
 
 
266 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  35.95 
 
 
266 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  35.95 
 
 
266 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  36.17 
 
 
271 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  33.89 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  33.89 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  34.58 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2044  IstB domain protein ATP-binding protein  35.07 
 
 
220 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307112  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2413  transposase, degenerate  35.07 
 
 
220 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  33.91 
 
 
250 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  35.65 
 
 
245 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  35.65 
 
 
245 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  35.65 
 
 
245 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  29.17 
 
 
251 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3281  IstB ATP binding domain-containing protein  33.05 
 
 
262 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  33.74 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  31.91 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4884  IstB-like ATP-binding protein  33.05 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4681  IstB ATP binding domain-containing protein  32 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  30.2 
 
 
251 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  31.73 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  31.73 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  31.73 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  31.73 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  29.06 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  30.42 
 
 
250 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  30.08 
 
 
245 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  28.81 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1225  IstB ATP binding domain-containing protein  29.34 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0987  IstB ATP binding domain-containing protein  29.34 
 
 
251 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1076  IstB ATP binding domain-containing protein  29.34 
 
 
251 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1298  IstB ATP binding domain-containing protein  29.34 
 
 
251 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0216  IstB domain protein ATP-binding protein  32.51 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.488281  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3288  IstB ATP binding domain-containing protein  34.63 
 
 
219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  29.34 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  29.06 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  29.06 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0891  IstB ATP binding domain-containing protein  29.34 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  29.06 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  29.06 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  29.06 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2661  IstB ATP binding domain-containing protein  29.34 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  29.06 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  29.24 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  29.24 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  30.9 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  30.9 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  30.9 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  33.47 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  30.64 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  33.47 
 
 
259 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  34.02 
 
 
259 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  28.63 
 
 
251 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  28.63 
 
 
251 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  33.47 
 
 
259 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  30.54 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  33.47 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  32.68 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  28.57 
 
 
249 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  28.57 
 
 
249 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  31.67 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  31.67 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  29.57 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  33.19 
 
 
264 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  33.19 
 
 
264 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  33.19 
 
 
264 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  33.19 
 
 
264 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  33.19 
 
 
264 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  33.19 
 
 
264 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  33.19 
 
 
285 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  33.19 
 
 
285 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  33.19 
 
 
264 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  30.71 
 
 
248 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  30.71 
 
 
248 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  30.71 
 
 
248 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3547  hypothetical protein  32.71 
 
 
249 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  28.69 
 
 
248 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>