More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2444 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0835  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1341  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.37984  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2444  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.751325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3085  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.854683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4314  IstB domain protein ATP-binding protein  82.28 
 
 
254 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0891  IstB domain protein ATP-binding protein  82.28 
 
 
254 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0681  IstB domain protein ATP-binding protein  82.28 
 
 
254 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0216  IstB domain protein ATP-binding protein  75.4 
 
 
256 aa  394  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.488281  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5343  IstB-like ATP-binding protein  76.21 
 
 
255 aa  367  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.867501  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  72.73 
 
 
255 aa  353  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  36.1 
 
 
257 aa  149  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1864  IstB domain protein ATP-binding protein  32.78 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  31.95 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  31.95 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  28.81 
 
 
252 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0360  IstB domain protein ATP-binding protein  30.96 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1309  IstB domain protein ATP-binding protein  30.96 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1892  IstB domain protein ATP-binding protein  30.96 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0595448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4251  IstB domain protein ATP-binding protein  30.96 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  28.75 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  32.2 
 
 
275 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  29.34 
 
 
694 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  32.06 
 
 
266 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1096  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2873  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1051  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0944  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2910  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2938  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333111  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4857  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232299  hitchhiker  0.00902527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1588  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4854  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.640312  hitchhiker  0.00176569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  31.95 
 
 
264 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6479  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  31.95 
 
 
264 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  31.95 
 
 
264 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  31.95 
 
 
264 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  31.95 
 
 
264 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  31.95 
 
 
264 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  31.95 
 
 
264 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2467  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 
269 aa  122  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1129  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  121  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3872  IstB domain protein ATP-binding protein  30.64 
 
 
263 aa  121  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  0.0551176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1064  IstB domain protein ATP-binding protein  34.42 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  31.4 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4884  IstB-like ATP-binding protein  32.64 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3281  IstB ATP binding domain-containing protein  32.64 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  31.58 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5620  IstB ATP binding domain-containing protein  32.35 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124688  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  30.2 
 
 
252 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0316  IstB domain protein ATP-binding protein  32.1 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2089  IstB domain protein ATP-binding protein  31.69 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3158  IstB domain protein ATP-binding protein  31.69 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230452  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  31.17 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  31.05 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  31.17 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  28.11 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  32.91 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  32.91 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  28.11 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1140  IstB domain protein ATP-binding protein  35.56 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241939  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  28.11 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  31.02 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  32.91 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  28.11 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  30.65 
 
 
259 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  30.65 
 
 
259 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  33.06 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  33.06 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  33.06 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  33.06 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  29.46 
 
 
268 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  33.06 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  33.06 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  33.06 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  33.06 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  33.06 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  31.93 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  31.93 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  31.17 
 
 
258 aa  111  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  31.17 
 
 
258 aa  111  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  30.65 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  31.27 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  31.27 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4904  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  30.95 
 
 
250 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1792  putative transposase-related ATP-binding protein  31.8 
 
 
262 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0585373  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  33.47 
 
 
262 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  32.2 
 
 
271 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  33.47 
 
 
262 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  33.47 
 
 
262 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  33.47 
 
 
262 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  33.47 
 
 
262 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  32.52 
 
 
262 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  32.52 
 
 
262 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  33.47 
 
 
262 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  32.52 
 
 
262 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  32.22 
 
 
262 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3716  IstB ATP binding domain-containing protein  27.5 
 
 
258 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>