More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4314 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4314  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0891  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0681  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3085  IstB ATP binding domain-containing protein  82.28 
 
 		 254 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.854683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1341  IstB ATP binding domain-containing protein  82.28 
 
 		 254 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.37984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0835  IstB ATP binding domain-containing protein  82.28 
 
 		 254 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2444  IstB ATP binding domain-containing protein  82.28 
 
 		 254 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.751325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0216  IstB domain protein ATP-binding protein  75.3 
 
 		 256 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.488281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5343  IstB-like ATP-binding protein  81.05 
 
 		 255 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.867501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  76.45 
 
 		 255 aa  367  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  35.71 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  34.75 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  30.04 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  29.58 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0360  IstB domain protein ATP-binding protein  31.17 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  30.92 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1309  IstB domain protein ATP-binding protein  31.17 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1892  IstB domain protein ATP-binding protein  31.17 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0595448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4251  IstB domain protein ATP-binding protein  31.17 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1588  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1096  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4857  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232299  hitchhiker  0.00902527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0944  IstB domain protein ATP-binding protein  36.24 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1051  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2873  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4854  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.640312  hitchhiker  0.00176569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  33.33 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2910  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6479  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2938  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1129  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  30.58 
 
 		 694 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1064  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  35.65 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  29.76 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  29.76 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3872  IstB domain protein ATP-binding protein  31.4 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  0.0551176 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  35.74 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1864  IstB domain protein ATP-binding protein  32.52 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  35.74 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  32.93 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  33.47 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  33.47 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  33.47 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  33.47 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  33.47 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  33.47 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  33.47 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  32.93 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  32.93 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  33.06 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2467  IstB ATP binding domain-containing protein  31.56 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  33.2 
 
 		 266 aa  121  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  31.76 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5620  IstB ATP binding domain-containing protein  33.19 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  32.53 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4884  IstB-like ATP-binding protein  34.45 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3281  IstB ATP binding domain-containing protein  34.45 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  34.19 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  34.19 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  34.19 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  32 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  32 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  32.58 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  32.58 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4736  IstB ATP binding domain-containing protein  34.71 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5654  IstB ATP binding domain-containing protein  34.71 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2512  IstB ATP binding domain-containing protein  34.71 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.931109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  31.27 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  31.27 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0316  IstB domain protein ATP-binding protein  31.25 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1191  IstB domain protein ATP-binding protein  32.93 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3858  IstB domain protein ATP-binding protein  32.93 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2089  IstB domain protein ATP-binding protein  30.83 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4904  IstB ATP binding domain-containing protein  33.19 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3158  IstB domain protein ATP-binding protein  30.83 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  32.93 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  29.02 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  29.02 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1140  IstB domain protein ATP-binding protein  37.36 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  29.02 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  29.02 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  32.27 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  33.48 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  26.97 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1792  putative transposase-related ATP-binding protein  31.38 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0585373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1641  IstB domain protein ATP-binding protein  31.82 
 
 		 277 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0105498  hitchhiker  0.00131223 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3716  IstB ATP binding domain-containing protein  27.5 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0109  IstB ATP binding domain-containing protein  27.5 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1008  IstB ATP binding domain-containing protein  27.5 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.126896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1320  IstB ATP binding domain-containing protein  27.5 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2855  IstB ATP binding domain-containing protein  27.5 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>