More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3843 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3843  aminotransferase class-III  100 
 
 
439 aa  896    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0711014  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1965  aminotransferase class-III  71.16 
 
 
432 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.392498  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5127  aminotransferase class-III  53.22 
 
 
437 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1467  aminotransferase class-III  47.87 
 
 
439 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0190555  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5257  aminotransferase class-III  41.67 
 
 
455 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.86 
 
 
432 aa  319  6e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  42.69 
 
 
432 aa  316  5e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.09 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  40.14 
 
 
437 aa  313  4.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  41.39 
 
 
426 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.05 
 
 
426 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.14 
 
 
426 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  41.39 
 
 
426 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.86 
 
 
426 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.14 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.14 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.14 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  40.14 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.14 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  41.67 
 
 
430 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.9 
 
 
426 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.85 
 
 
427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.9 
 
 
426 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.67 
 
 
426 aa  309  8e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.9 
 
 
426 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.9 
 
 
426 aa  309  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  39.9 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.62 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  41.55 
 
 
431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1717  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  41.23 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.189585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.38 
 
 
427 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.86 
 
 
426 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.39 
 
 
426 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0610  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40 
 
 
433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.66 
 
 
429 aa  306  6e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.97 
 
 
428 aa  306  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.38 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  39.72 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1413  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.62 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.190145 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.56 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  41.09 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0558  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.77 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.655288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  39 
 
 
427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.32 
 
 
426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0261  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.45 
 
 
433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.44 
 
 
427 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.43 
 
 
427 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0827  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.71 
 
 
423 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.215136  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.67 
 
 
426 aa  302  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.67 
 
 
426 aa  302  9e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.67 
 
 
426 aa  302  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.95 
 
 
428 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1325  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.9 
 
 
444 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.66 
 
 
425 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2254  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  42.02 
 
 
423 aa  301  2e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.100829  normal  0.0981223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.2 
 
 
427 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.77 
 
 
434 aa  299  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.16 
 
 
432 aa  298  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2625  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.19 
 
 
429 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1396  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  40 
 
 
440 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.41 
 
 
431 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2628  aminotransferase class-III  43.5 
 
 
436 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.31 
 
 
433 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1419  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.66 
 
 
444 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.24 
 
 
427 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.35 
 
 
425 aa  296  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.11 
 
 
424 aa  296  6e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0896  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.95 
 
 
427 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.33 
 
 
432 aa  296  6e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38 
 
 
431 aa  296  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.01 
 
 
427 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.14 
 
 
417 aa  295  9e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  40.96 
 
 
429 aa  295  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  39.2 
 
 
427 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.56 
 
 
430 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.03 
 
 
445 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.65 
 
 
430 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.32 
 
 
626 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  39.49 
 
 
426 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38 
 
 
427 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.56 
 
 
428 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  40.62 
 
 
452 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.86 
 
 
427 aa  293  6e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4838  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.53 
 
 
427 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.41 
 
 
430 aa  292  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.41 
 
 
430 aa  292  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3098  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.02 
 
 
427 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.41 
 
 
430 aa  292  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.1 
 
 
431 aa  292  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  41.33 
 
 
436 aa  292  9e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108936  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.86 
 
 
427 aa  292  9e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2901  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.66 
 
 
430 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0920757  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1239  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.88 
 
 
426 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1293  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  42.27 
 
 
438 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.14 
 
 
429 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0667  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.86 
 
 
430 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139196  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3303  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.66 
 
 
430 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.38 
 
 
427 aa  292  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1492  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.92 
 
 
429 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.79 
 
 
433 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>