More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3772 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  90.36 
 
 		 363 aa  666    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 363 aa  721    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  40.44 
 
 		 374 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  38.33 
 
 		 371 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  42.27 
 
 		 372 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  41.05 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 372 aa  282  7.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  43.02 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  43.01 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  41.78 
 
 		 373 aa  278  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  42.34 
 
 		 371 aa  278  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  40.72 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  41.86 
 
 		 371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  41.86 
 
 		 371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  41.93 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  41.83 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  41.86 
 
 		 371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  41.42 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  43.49 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  38.61 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  42.74 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  43.18 
 
 		 406 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  42.27 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  42.27 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  42.27 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  40.29 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  40.98 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  39.89 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  42 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  40.28 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  43.35 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  43.35 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  41.83 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  42.74 
 
 		 377 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  40.86 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  45.58 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4017  alanine dehydrogenase  41 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  43.71 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  41 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  43.71 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  41 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  40.44 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  38.86 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  41 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  44.83 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  44.57 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  40.72 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  40.44 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  40.63 
 
 		 370 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  43.43 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  43.18 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  43.14 
 
 		 370 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  42.22 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  40.57 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  40 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  40 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  40 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  40 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  40 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  40 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  44.57 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  40.77 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  40 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  40 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  42.57 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  42.29 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  40.83 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  40 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  40.5 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  41.39 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  40.33 
 
 		 371 aa  259  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  40.72 
 
 		 365 aa  258  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  43.14 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  43.3 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  41.67 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  41.14 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  38.67 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  38.67 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  43.36 
 
 		 371 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  40.5 
 
 		 371 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  43.43 
 
 		 371 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  43.43 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  43.43 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  40.53 
 
 		 373 aa  256  6e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  41.39 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2381  alanine dehydrogenase  42.22 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0319294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  41.88 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  41.43 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>