35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3714 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  87.08 
 
 		 182 aa  326  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  26.86 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  26.29 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  25.15 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  36.43 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  25.99 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  25.99 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  31.69 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  33.82 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  25.42 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  25.42 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  32.06 
 
 		 525 aa  58.2  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  26.59 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  33.33 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  34.45 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  34.19 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  33.59 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2376  hypothetical protein  28.09 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  29.95 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1951  putative kinase  34 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  30.56 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  28.68 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  28.45 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  26.46 
 
 		 520 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  26.6 
 
 		 520 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2247  putative kinase  32.56 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0955  hypothetical protein  45 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  56.25 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  22.89 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  44.68 
 
 		 178 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0168  shikimate kinase  44.68 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00656319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  29.46 
 
 		 529 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  23.87 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  54.84 
 
 		 594 aa  41.2  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>