34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2976 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2976  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0690747  hitchhiker  0.0000187437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  70.45 
 
 		 148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  55.22 
 
 		 138 aa  144  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  47.37 
 
 		 135 aa  116  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  43.94 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  34.09 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  31.39 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  31.39 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4025  hypothetical protein  34.59 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4188  hypothetical protein  35.51 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  30.15 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  30.37 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  33.58 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  30.34 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  33.33 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  31.72 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  29.86 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  27.61 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  29.63 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3055  hypothetical protein  34.53 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  27.54 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  30.5 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  25.9 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  30.99 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  28.68 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  26.28 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4435  hypothetical protein  25.87 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0434783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  24.63 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  26.52 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>